More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2238 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
374 aa  765    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  52.8 
 
 
384 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  36.91 
 
 
379 aa  243  6e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
359 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
367 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  30 
 
 
371 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 
368 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  26.13 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.02 
 
 
461 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  23.45 
 
 
364 aa  90.5  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.54 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.28 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.57 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  23.5 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  26.67 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.22 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.22 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  28.51 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  24.37 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  26.69 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  27.12 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  27.12 
 
 
423 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  29.38 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.49 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 
789 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 
789 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.4 
 
 
789 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  25.85 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  25.85 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  25.85 
 
 
423 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.1 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.1 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
441 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.1 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
425 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.18 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.21 
 
 
694 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  25.61 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  27.12 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  26.62 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  26.62 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  26.62 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.19 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  33.33 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
528 aa  69.3  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
344 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  22.05 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  22.05 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4553  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
248 aa  67  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.9 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.85 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  25.85 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28 
 
 
479 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  26.59 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  36.79 
 
 
243 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  51.72 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  26.46 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
259 aa  64.7  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0338  cell wall biogenesis glycosyltransferase  29.55 
 
 
242 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.84 
 
 
322 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
289 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
423 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
311 aa  63.5  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.07 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.07 
 
 
822 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>