More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2219 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0992  threonyl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 653 aa  891    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0172  threonyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 659 aa  717    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 645 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 634 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 645 aa  640    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 645 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  646    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 644 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0167  threonyl-tRNA synthetase  53.2 
 
 		 657 aa  732    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  646    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 596 aa  636    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 647 aa  1335    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0176  threonyl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 657 aa  735    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 635 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0024  threonyl-tRNA synthetase  66.08 
 
 		 648 aa  882    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0123  threonyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 		 677 aa  725    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0729429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1715  threonyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 		 657 aa  743    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1221  threonyl-tRNA synthetase  78.64 
 
 		 647 aa  1064    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.001104  hitchhiker  0.00620187 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 645 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4204  threonyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 736 aa  651    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2175  threonyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 648 aa  642    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 633 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 643 aa  645    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  66.1 
 
 		 662 aa  900    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 645 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 639 aa  657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00815  threonyl-tRNA synthetase  65.26 
 
 		 648 aa  897    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.270847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1507  threonyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 649 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.266157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  51.26 
 
 		 635 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 645 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  79.03 
 
 		 645 aa  1076    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2850  threonyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 604 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0185982  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0156  threonyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 657 aa  722    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0992  threonyl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 647 aa  895    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1906  threonyl-tRNA synthetase  76.88 
 
 		 641 aa  1050    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0559  threonyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 		 644 aa  939    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00454252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  72.46 
 
 		 646 aa  1002    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2501  threonyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 675 aa  725    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 652 aa  651    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1246  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 		 645 aa  632  1e-180  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1740  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 645 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0523763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1774  threonyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 645 aa  634  1e-180  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0613  threonyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 648 aa  631  1e-179  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 638 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 635 aa  625  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 644 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 636 aa  619  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 635 aa  621  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 635 aa  620  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 638 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 637 aa  621  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 645 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0711  threonyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 647 aa  618  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 643 aa  614  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 636 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 643 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 636 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 659 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 642 aa  609  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 		 634 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 645 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2483  threonyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 637 aa  602  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0764303  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2606  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 604 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0580419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 646 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 648 aa  604  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 638 aa  599  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1732  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 630 aa  601  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1383  threonyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 608 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.520119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 639 aa  599  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0801  threonyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 647 aa  599  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00121365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 644 aa  598  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 636 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 636 aa  601  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 638 aa  597  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 640 aa  595  1e-168  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0387  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 610 aa  592  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.677095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2787  threonyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 615 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 644 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 640 aa  592  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 635 aa  592  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1457  threonyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 688 aa  589  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 687 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2368  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 644 aa  589  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.642893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 635 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 635 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 635 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 635 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 		 635 aa  588  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 661 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2181  threonyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 646 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 635 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>