More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  60.44 
 
 		 669 aa  713    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  68.51 
 
 		 696 aa  835    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  100 
 
 		 692 aa  1376    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  56.6 
 
 		 672 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  51.84 
 
 		 690 aa  635    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  57.86 
 
 		 679 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  65.56 
 
 		 728 aa  842    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  50.07 
 
 		 706 aa  625  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  52.37 
 
 		 681 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  52.55 
 
 		 765 aa  627  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  52.06 
 
 		 685 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  52.47 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  50.5 
 
 		 699 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  49.93 
 
 		 673 aa  591  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  53.69 
 
 		 706 aa  588  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  53.94 
 
 		 670 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  51.22 
 
 		 684 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  52.23 
 
 		 699 aa  583  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.98 
 
 		 666 aa  580  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.36 
 
 		 694 aa  571  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  52.24 
 
 		 665 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  52.24 
 
 		 665 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  52.24 
 
 		 665 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  52.76 
 
 		 676 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  51.74 
 
 		 677 aa  555  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  51.04 
 
 		 664 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  49.34 
 
 		 683 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  49.49 
 
 		 699 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  52.3 
 
 		 676 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  47.16 
 
 		 664 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  48.23 
 
 		 710 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  32.7 
 
 		 674 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  34.18 
 
 		 660 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  44.67 
 
 		 844 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.29 
 
 		 725 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  33.83 
 
 		 650 aa  286  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  33.58 
 
 		 650 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  33.77 
 
 		 643 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  31.77 
 
 		 658 aa  281  4e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  32.96 
 
 		 725 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.43 
 
 		 640 aa  280  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  30.72 
 
 		 707 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  33.13 
 
 		 639 aa  277  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  32.83 
 
 		 647 aa  276  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  30.96 
 
 		 647 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  33.01 
 
 		 743 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  32.11 
 
 		 713 aa  273  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  31.82 
 
 		 646 aa  269  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  35.98 
 
 		 649 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  35.04 
 
 		 673 aa  266  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  31.72 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  31.72 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  31.57 
 
 		 636 aa  264  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  31.57 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  31.57 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  32.05 
 
 		 636 aa  263  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  32.09 
 
 		 634 aa  262  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  32.09 
 
 		 634 aa  262  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.13 
 
 		 651 aa  261  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.74 
 
 		 652 aa  261  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  31.57 
 
 		 636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  31.42 
 
 		 636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  31.77 
 
 		 634 aa  260  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  32.11 
 
 		 668 aa  260  7e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  32.94 
 
 		 639 aa  260  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.77 
 
 		 641 aa  259  8e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  31.28 
 
 		 634 aa  259  8e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  32.15 
 
 		 646 aa  259  1e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  29.62 
 
 		 652 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.6 
 
 		 960 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  32.03 
 
 		 641 aa  257  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  32.03 
 
 		 641 aa  257  5e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  32.76 
 
 		 653 aa  257  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  33.58 
 
 		 664 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.26 
 
 		 646 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.34 
 
 		 927 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  34.33 
 
 		 649 aa  255  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  29.4 
 
 		 674 aa  254  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  29.9 
 
 		 641 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2196  helicase c2  29.65 
 
 		 641 aa  253  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  30.98 
 
 		 664 aa  253  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  28.51 
 
 		 662 aa  253  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  30.49 
 
 		 644 aa  253  8.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  32.62 
 
 		 757 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1863  helicase c2  32.16 
 
 		 668 aa  253  9.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.879395 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.03 
 
 		 659 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1619  helicase c2  28.86 
 
 		 629 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  29.59 
 
 		 659 aa  251  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  32.63 
 
 		 649 aa  249  9e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2172  helicase c2  29.73 
 
 		 659 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  30.22 
 
 		 669 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  30.22 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  29.15 
 
 		 633 aa  247  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>