236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2582 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2853  Na+/H+ antiporter NhaC  85.38 
 
 		 526 aa  900    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2864  Na+/H+ antiporter NhaC  80.89 
 
 		 522 aa  811    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1513  Na+/H+ antiporter NhaC  80.89 
 
 		 522 aa  811    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.235821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2993  Na+/H+ antiporter NhaC  80.69 
 
 		 522 aa  807    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2537  Na+/H+ antiporter NhaC  73.65 
 
 		 524 aa  797    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0181032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3234  Na+/H+ antiporter NhaC  87.86 
 
 		 524 aa  905    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.22979 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1354  Na+/H+ antiporter NhaC  81 
 
 		 522 aa  871    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0897307  hitchhiker  0.00505765 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1419  Na+/H+ antiporter NhaC  81.19 
 
 		 522 aa  872    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.116291  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2746  Na+/H+ antiporter NhaC  78.1 
 
 		 518 aa  829    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00133012  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1407  Na+/H+ antiporter NhaC  81 
 
 		 522 aa  870    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0192762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1171  Na+/H+ antiporter NhaC  79 
 
 		 520 aa  801    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1447  Na+/H+ antiporter NhaC  88.68 
 
 		 521 aa  915    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0476747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2845  Na+/H+ antiporter NhaC  80.89 
 
 		 522 aa  811    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2582  Na+/H+ antiporter NhaC  100 
 
 		 521 aa  1034    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2509  Na+/H+ antiporter NhaC  81.66 
 
 		 522 aa  860    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000317114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01828  Na+/H+ antiporter  55.68 
 
 		 533 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2144  putative sodium/proton antiporter  54.91 
 
 		 528 aa  573  1.0000000000000001e-162  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.382499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003851  malate Na(+) symporter  55.84 
 
 		 533 aa  568  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0701  hypothetical protein  57.26 
 
 		 533 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1009  Na+/H+ antiporter NhaC  54.32 
 
 		 521 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1007  Na(+)/H(+) antiporter  54.02 
 
 		 526 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1016  hypothetical protein  54.35 
 
 		 529 aa  537  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3259  Na+/H+ antiporter NhaC  51.82 
 
 		 527 aa  531  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0788  Na(+)/H(+) antiporter  48.1 
 
 		 515 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1645  Na+/H+ antiporter NhaC  44.96 
 
 		 520 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07900  Na+/H+ antiporter  43.46 
 
 		 546 aa  356  6.999999999999999e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0897  Na+/H+ antiporter NhaC  43.31 
 
 		 525 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1703  Na+ antiporter NhaC  43.51 
 
 		 525 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1066  Na+/H+ antiporter NhaC  39.34 
 
 		 574 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0208  Na+/H+ antiporter NhaC  42.71 
 
 		 533 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1408  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  38.18 
 
 		 550 aa  316  7e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1513  Na+ antiporter NhaC  41.54 
 
 		 534 aa  313  6.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.483859  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05850  Na+/H+ antiporter  37.34 
 
 		 525 aa  312  9e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0325247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1683  Na+/H+ antiporter NhaC  36.95 
 
 		 528 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12680  Na+/H+ antiporter  37.48 
 
 		 532 aa  300  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.33176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1419  Na(+)/H(+) antiporter family protein  37.6 
 
 		 567 aa  299  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000092827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0222  Na+/H+ antiporter NhaC  36.44 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4190  Na+/H+ antiporter NhaC  38.83 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0239157  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3955  Na+/H+ antiporter NhaC  39.19 
 
 		 497 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2649  Na+/H+ antiporter NhaC  37.58 
 
 		 510 aa  289  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4150  Na+/H+ antiporter NhaC  39.52 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4057  Na+/H+ antiporter NhaC  38.97 
 
 		 497 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4032  Na+/H+ antiporter NhaC  38.66 
 
 		 497 aa  286  8e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3653  Na+/H+ antiporter NhaC  38.86 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0070  Na+/H+ antiporter NhaC  35.51 
 
 		 552 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.837679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0336  Na(+)/H(+) antiporter  36.93 
 
 		 507 aa  282  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0314  Na+/H+ antiporter NhaC  36.25 
 
 		 493 aa  279  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3639  Na+/H+ antiporter NhaC  38.33 
 
 		 501 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0305  Na+/H+ antiporter NhaC  38.2 
 
 		 501 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1375  Na(+)/H(+) antiporter family protein  34.94 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3835  Na+/H+ antiporter NhaC  38.33 
 
 		 501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1424  Na+/H+ antiporter NhaC  34.37 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0208  hypothetical protein  36.98 
 
 		 569 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0970  Na+/H+ antiporter family protein  35.48 
 
 		 570 aa  269  8e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2536  Na(+)/H(+) antiporter family protein  35.14 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2850  Na+/H+ antiporter family protein  35.14 
 
 		 571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1405  Na(+)/H(+) antiporter family protein  37.57 
 
 		 567 aa  266  5e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.165118  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  36.87 
 
 		 517 aa  266  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19140  Na+/H+ antiporter NhaC  36.36 
 
 		 521 aa  262  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000186366  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004330  Na+/H+ antiporter NhaC  34.1 
 
 		 507 aa  249  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0849  Na+/H+ antiporter family protein  33.08 
 
 		 577 aa  249  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1746  Na+/H+ antiporter NhaC  36.31 
 
 		 561 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.230963 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1182  Na+/H+ antiporter family protein  33.33 
 
 		 577 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0921  Na+/H+ antiporter NhaC  32.89 
 
 		 513 aa  246  6.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000452516  hitchhiker  5.2738399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3318  Na+/H+ antiporter  36.98 
 
 		 508 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.285563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2134  Na+/H+ antiporter NhaC  33.4 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142.2  Na(+)/H(+) antiporter  84.21 
 
 		 138 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0919  Na+/H+ antiporter family protein  32.5 
 
 		 577 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2431  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  35.64 
 
 		 556 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1647  Na+/H+ antiporter NhaC  35.6 
 
 		 629 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1377  Na+/H+ antiporter NhaC  35.94 
 
 		 541 aa  237  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1817  Na+/H+ antiporter NhaC  34.48 
 
 		 476 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1182  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.04 
 
 		 564 aa  233  6e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1884  Na+/H+ antiporter NhaC  32.71 
 
 		 457 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1791  Na+/H+ antiporter NhaC  35.01 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3882  Na+/H+ antiporter NhaC  32.86 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2481  hypothetical protein  32.8 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0611  hypothetical protein  31.49 
 
 		 587 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2247  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 		 460 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000466881  decreased coverage  0.0000000000662614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2137  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 		 460 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000622786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2187  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 		 460 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000561486  unclonable  0.00000648727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1071  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  34.05 
 
 		 560 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4520  hypothetical protein  32.28 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2234  Na+/H+ antiporter NhaC  32.28 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000146324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1873  Na+/H+ antiporter NhaC  31.67 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0663554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3425  Na+/H+ antiporter NhaC  32.14 
 
 		 460 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000177895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0698  Na+/H+ antiporter NhaC  32.48 
 
 		 460 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4723  Na+/H+ antiporter family protein  29.02 
 
 		 493 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.448886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0699  Na+/H+ antiporter NhaC  32.48 
 
 		 460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0779  Na+/H+ antiporter NhaC  31.31 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.129292  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2039  Na+/H+ antiporter NhaC  31.87 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  hitchhiker  0.00385461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1936  Na+/H+ antiporter NhaC  31.87 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000100121  hitchhiker  0.00835869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2144  Na+/H+ antiporter NhaC  31.87 
 
 		 460 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0101498  hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1698  hypothetical protein  31.14 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000332347  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3287  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  32.45 
 
 		 638 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115901  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1184  Na+/H+ antiporter NhaC  31.97 
 
 		 448 aa  203  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0529318  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49064  predicted protein  28.65 
 
 		 779 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3604  hypothetical protein  31.3 
 
 		 466 aa  192  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4063  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  31.79 
 
 		 594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00591  Na+/H+ antiporter family protein  31.15 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>