60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11960  putative cell wall binding protein  100 
 
 		 578 aa  1182    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000480831  normal  0.155715 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00690  putative cell wall binding protein  27.36 
 
 		 2495 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07880  glucan-binding domain-containing protein  39.05 
 
 		 651 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352799 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00880  putative cell wall binding protein  41.46 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  0.955176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  49.6 
 
 		 302 aa  107  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11330  putative cell wall binding protein  48.62 
 
 		 502 aa  100  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.307599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25520  conserved repeat protein  37.7 
 
 		 613 aa  99.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0611  cell wall binding repeat-containing protein  32.2 
 
 		 430 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06260  glucan-binding domain-containing protein  43.94 
 
 		 324 aa  94.7  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  42.06 
 
 		 602 aa  94.4  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05950  glucan-binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 753 aa  94  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000330124  hitchhiker  0.0000000000107499 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14450  glucan-binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 532 aa  94  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.521361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02530  glucan-binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 377 aa  89  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.459016  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0606  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  33.9 
 
 		 550 aa  87.8  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.907737  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06430  M6 family metalloprotease domain-containing protein  44.09 
 
 		 811 aa  88.2  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0919314 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0597  surface protein pspA precursor  30.29 
 
 		 434 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09550  putative cell wall binding protein  46.79 
 
 		 331 aa  86.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0189396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  31.98 
 
 		 454 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16990  glucan-binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0605  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase domain-containing protein  32.1 
 
 		 807 aa  84  0.000000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.187255  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00230  dipeptidase  38.85 
 
 		 750 aa  82.8  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762022 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0550  cell wall binding repeat-containing protein  30.13 
 
 		 330 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.515915  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0593  cell wall binding repeat-containing protein  42.15 
 
 		 552 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000201841  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05190  putative cell wall binding protein  42.11 
 
 		 440 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14440  subtilase family protease  39.55 
 
 		 817 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0592  cell wall binding repeat-containing protein/mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  39.83 
 
 		 891 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0288009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0591  cell wall binding repeat-containing protein/zinc carboxypeptidase family protein  32.34 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000159659  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08300  glycosyl hydrolase family 25  40.5 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.39526 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  40.52 
 
 		 1732 aa  77.4  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14470  putative cell wall binding protein  38.93 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.444931 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04260  putative cell wall binding protein  35.43 
 
 		 465 aa  76.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.878918  normal  0.401989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16000  putative cell wall binding protein  43.12 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000272933 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05010  putative cell wall binding protein  44.32 
 
 		 203 aa  70.1  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0490  cell wall binding repeat-containing protein  30.69 
 
 		 1557 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14460  glucan-binding domain-containing protein  36.44 
 
 		 757 aa  66.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.706218  normal  0.855897 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02590  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.39 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000561164 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0891  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.54 
 
 		 762 aa  62.4  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0223841  normal  0.138276 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0121  S-layer domain-containing ribonuclease  29.35 
 
 		 1131 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104142 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0151  S-layer domain ribonuclease  29.35 
 
 		 1131 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.965938  hitchhiker  0.000000320353 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5584  cell wall binding repeat-containing protein  28 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0013  peptidoglycan hydrolase  33.59 
 
 		 589 aa  54.7  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0013556  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15380  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.25 
 
 		 268 aa  54.3  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00636935  normal  0.0253427 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02470  putative cell wall binding protein  33.65 
 
 		 271 aa  53.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.901982 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1747  YG repeat-containing glycosyl hydrolase family 70 protein  29.09 
 
 		 1527 aa  51.6  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0091  hypothetical protein  29.33 
 
 		 587 aa  51.6  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  56.82 
 
 		 1882 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  47.92 
 
 		 1842 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.66 
 
 		 350 aa  47.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0114709  normal  0.325418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1195  hypothetical protein  32.88 
 
 		 1247 aa  47.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0540388 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0857  glycosyl hydrolase  29.57 
 
 		 2821 aa  47  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0939  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1323 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.552149  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  28.77 
 
 		 420 aa  47  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1052 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  28.19 
 
 		 697 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0945  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1331 aa  46.2  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  28.03 
 
 		 1514 aa  46.2  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1346  dextransucrase  28.38 
 
 		 1363 aa  45.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1367  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.09 
 
 		 474 aa  44.7  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000955772  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0535  YG repeat-containing cell wall-associated hydrolase  33.75 
 
 		 292 aa  44.3  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1988  Ig domain protein group 2 domain protein  46.15 
 
 		 1732 aa  43.5  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.16697  normal  0.151992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>