More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1575 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 435 aa  864    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  66.21 
 
 		 435 aa  631  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  66.67 
 
 		 435 aa  626  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  65.75 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  66.21 
 
 		 435 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  65.52 
 
 		 435 aa  621  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  68.98 
 
 		 429 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  65.68 
 
 		 437 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  65.75 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  62.61 
 
 		 442 aa  565  1e-160  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  60.69 
 
 		 437 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  61.84 
 
 		 437 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  60.23 
 
 		 437 aa  555  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  62.3 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  62.12 
 
 		 447 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  62 
 
 		 445 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  61.65 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  60.94 
 
 		 447 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  57.57 
 
 		 437 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  62.53 
 
 		 435 aa  537  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  60.32 
 
 		 437 aa  530  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  59.73 
 
 		 448 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  57.91 
 
 		 443 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  57.91 
 
 		 443 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  56.45 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  58.62 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  56.88 
 
 		 446 aa  501  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  56.88 
 
 		 446 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  56.42 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  57.11 
 
 		 440 aa  497  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  56.09 
 
 		 446 aa  495  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  56.64 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  57.64 
 
 		 453 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  56.78 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  56 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  56.42 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  56.55 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  57.18 
 
 		 437 aa  491  1e-137  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  56.32 
 
 		 446 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  57.8 
 
 		 437 aa  488  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  57.95 
 
 		 436 aa  485  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  55.5 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  56.81 
 
 		 440 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  56.32 
 
 		 443 aa  487  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  54.38 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  56.78 
 
 		 446 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  56.68 
 
 		 436 aa  484  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  54.67 
 
 		 443 aa  482  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  53.44 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  55.17 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  55.71 
 
 		 442 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  55.96 
 
 		 445 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  53.4 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  56.45 
 
 		 447 aa  474  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  54.71 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  57.7 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  55.3 
 
 		 443 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  56.2 
 
 		 439 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  56.32 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  55.99 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  55.92 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  55.58 
 
 		 444 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  53.26 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  55.07 
 
 		 443 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  54.61 
 
 		 442 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  53.02 
 
 		 446 aa  471  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  53.26 
 
 		 446 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  52.68 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  55.99 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  51.75 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  52.68 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  52.68 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  52.21 
 
 		 442 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0343  preprotein translocase, SecY subunit  53.94 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  55.99 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  56.15 
 
 		 439 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  52.68 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  52.68 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  54.19 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  52.68 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  52.93 
 
 		 446 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  53.95 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1658  preprotein translocase subunit SecY  55.86 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  53.95 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  53.95 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  53.95 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  54.71 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  55.12 
 
 		 437 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  53.49 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  53.72 
 
 		 446 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  53.26 
 
 		 446 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  54.1 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3297  preprotein translocase subunit SecY  54.71 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  54.27 
 
 		 448 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>