More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0306 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 503 aa  1030    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  56.29 
 
 		 509 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  55.56 
 
 		 503 aa  588  1e-166  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  55.04 
 
 		 517 aa  568  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  54.11 
 
 		 505 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  55.16 
 
 		 525 aa  567  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  54.02 
 
 		 507 aa  555  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  53.92 
 
 		 508 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  53.82 
 
 		 532 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.92 
 
 		 505 aa  547  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  54.82 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.92 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  54.64 
 
 		 513 aa  544  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.72 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  52.59 
 
 		 524 aa  525  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  51.95 
 
 		 536 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 522 aa  521  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 536 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  50.89 
 
 		 522 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  51.4 
 
 		 516 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  51.76 
 
 		 541 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  53.4 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08820  2-isopropylmalate synthase  52.09 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.834737  normal  0.224483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  51.52 
 
 		 516 aa  508  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  51.46 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2153  2-isopropylmalate synthase  52.21 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 523 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 515 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  52.01 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  49.11 
 
 		 519 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3559  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 528 aa  504  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  51.56 
 
 		 530 aa  500  1e-140  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  51.2 
 
 		 522 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  50.9 
 
 		 520 aa  501  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 523 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1866  2-isopropylmalate synthase  52.29 
 
 		 510 aa  501  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.229145 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 539 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3535  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 520 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2777  2-isopropylmalate synthase  51.7 
 
 		 511 aa  495  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  51.37 
 
 		 541 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  48.2 
 
 		 510 aa  495  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 520 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 516 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0391  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 509 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0745  2-isopropylmalate synthase  48.2 
 
 		 524 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  48.9 
 
 		 520 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0989  2-isopropylmalate synthase  51.31 
 
 		 515 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000770176 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 513 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 539 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 511 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3795  2-isopropylmalate synthase  48.49 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3607  2-isopropylmalate synthase  48.49 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1965  2-isopropylmalate synthase  48.75 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1553  2-isopropylmalate synthase  48.94 
 
 		 556 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.491054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  47.49 
 
 		 519 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 521 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 514 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 513 aa  490  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 513 aa  491  1e-137  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1986  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 511 aa  488  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 512 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 523 aa  488  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 510 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  49.5 
 
 		 523 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  48.89 
 
 		 515 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  48.39 
 
 		 523 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 519 aa  490  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  48.89 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  50.81 
 
 		 518 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  49.09 
 
 		 515 aa  488  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2283  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.923372 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  49.51 
 
 		 546 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5587  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 514 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774339 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 516 aa  488  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1609  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 508 aa  485  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.192076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2345  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 512 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3225  2-isopropylmalate synthase  49.7 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2065  2-isopropylmalate synthase  48.49 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1648  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2017  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.409159  normal  0.649599 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1333  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 515 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145859  normal  0.128519 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2259  2-isopropylmalate synthase  50.5 
 
 		 514 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 523 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2374  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 512 aa  485  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  48.89 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  50.78 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  49.9 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 515 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  48.1 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0551  2-isopropylmalate synthase  51.11 
 
 		 517 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.235647  hitchhiker  0.000444348 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00817  2-isopropylmalate synthase  48.09 
 
 		 544 aa  481  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>