More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3773 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  52.76 
 
 		 735 aa  752    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  62.45 
 
 		 736 aa  948    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  60.94 
 
 		 737 aa  875    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  63.26 
 
 		 738 aa  943    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  62.92 
 
 		 738 aa  949    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  71.1 
 
 		 737 aa  1068    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  62.19 
 
 		 735 aa  914    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  64.54 
 
 		 734 aa  960    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  50.88 
 
 		 745 aa  694    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  61.44 
 
 		 751 aa  919    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  63.26 
 
 		 737 aa  942    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  63.56 
 
 		 738 aa  954    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  63.56 
 
 		 738 aa  954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  63.16 
 
 		 738 aa  947    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  100 
 
 		 754 aa  1531    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  63.07 
 
 		 738 aa  946    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  63.26 
 
 		 738 aa  942    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  62.68 
 
 		 739 aa  948    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  37.29 
 
 		 776 aa  446  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  36.12 
 
 		 771 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  33.9 
 
 		 764 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  33.73 
 
 		 741 aa  398  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.82 
 
 		 748 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  33.47 
 
 		 728 aa  360  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  32.55 
 
 		 745 aa  360  6e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  32.4 
 
 		 728 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  33.2 
 
 		 728 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.78 
 
 		 727 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  33.01 
 
 		 750 aa  351  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  32.42 
 
 		 733 aa  346  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  32.47 
 
 		 777 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  31.52 
 
 		 751 aa  343  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.59 
 
 		 728 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  31.41 
 
 		 728 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  31.45 
 
 		 790 aa  337  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  31.96 
 
 		 767 aa  310  8e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  30.56 
 
 		 852 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  31.19 
 
 		 920 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  31.19 
 
 		 930 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  32.18 
 
 		 803 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  32.18 
 
 		 803 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  32.04 
 
 		 803 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  30.95 
 
 		 796 aa  299  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  35.14 
 
 		 667 aa  298  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 933 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  30.23 
 
 		 945 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  30.27 
 
 		 728 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  30.87 
 
 		 813 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  32.13 
 
 		 804 aa  294  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  30.77 
 
 		 798 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  36.22 
 
 		 753 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  29.67 
 
 		 714 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0465  patatin  31.59 
 
 		 729 aa  271  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.59 
 
 		 760 aa  222  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  28.5 
 
 		 740 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.17 
 
 		 740 aa  201  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  30.45 
 
 		 720 aa  201  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  26.04 
 
 		 733 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  34.11 
 
 		 746 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  40.22 
 
 		 923 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  37.41 
 
 		 909 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  32.14 
 
 		 950 aa  165  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  33.07 
 
 		 875 aa  161  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  35.14 
 
 		 900 aa  155  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  35.29 
 
 		 981 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  34.74 
 
 		 894 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  30.6 
 
 		 775 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  33.11 
 
 		 707 aa  150  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  34.58 
 
 		 293 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  35.4 
 
 		 311 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  36.69 
 
 		 262 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  33.69 
 
 		 263 aa  147  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  33.21 
 
 		 263 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  33.21 
 
 		 263 aa  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  33.21 
 
 		 263 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  33.21 
 
 		 263 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  33.21 
 
 		 263 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  33.21 
 
 		 263 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.86 
 
 		 263 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  32.29 
 
 		 320 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  36 
 
 		 273 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  33.57 
 
 		 263 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.5 
 
 		 263 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  33.58 
 
 		 272 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  33.57 
 
 		 263 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  34.04 
 
 		 253 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  34.13 
 
 		 323 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.76 
 
 		 311 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  33.81 
 
 		 333 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  31.88 
 
 		 256 aa  136  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  33.45 
 
 		 320 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  33.45 
 
 		 320 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  31.88 
 
 		 260 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  32.65 
 
 		 259 aa  132  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  32.61 
 
 		 318 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  31.01 
 
 		 324 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  32.61 
 
 		 318 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  36.7 
 
 		 323 aa  129  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  30.9 
 
 		 302 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.17 
 
 		 330 aa  127  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>