More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3291 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  63.18 
 
 		 265 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  63.86 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  63.45 
 
 		 259 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  63.45 
 
 		 259 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  63.05 
 
 		 259 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  61.45 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  62.4 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  60.47 
 
 		 258 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  60.89 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  60.24 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  60.24 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  60.24 
 
 		 259 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  60.26 
 
 		 259 aa  309  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  57.59 
 
 		 258 aa  299  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  60.16 
 
 		 260 aa  297  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  29.03 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.8 
 
 		 684 aa  88.6  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  29.7 
 
 		 425 aa  79  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.23 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  32.45 
 
 		 831 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  36.52 
 
 		 789 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.11 
 
 		 2413 aa  72  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1402 aa  72  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.82 
 
 		 961 aa  72  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.29 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.07 
 
 		 557 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  32.23 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.23 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  32.23 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  30.32 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1037 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 		 976 aa  68.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  31.48 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.79 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.88 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.73 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.57 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.57 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.69 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  37.33 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29.31 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.39 
 
 		 185 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.36 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  39.29 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  31.78 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  30.46 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  35.29 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  30.63 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.04 
 
 		 1493 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.22 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.82 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.17 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.68 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.58 
 
 		 731 aa  62  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 		 509 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 		 258 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1079  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.13 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.79 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.21 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  36.43 
 
 		 839 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  38.46 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  37.63 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  35.16 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  25.38 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0157  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2369  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  38.24 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  28.57 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  37.04 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2289  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2790  hypothetical protein  34.31 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  38.78 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.36 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  38.24 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  36.84 
 
 		 961 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.31 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1002 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.84 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.48 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  26.71 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.04 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.38 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.65 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  32 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>