More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3411 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 
259 aa  534  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  99.61 
 
 
259 aa  530  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  98.84 
 
 
259 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  94.59 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  84.94 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  84.56 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  84.56 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  84.94 
 
 
259 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  81.85 
 
 
259 aa  454  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  62.93 
 
 
259 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  62.02 
 
 
258 aa  347  8e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  63.32 
 
 
260 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  60.24 
 
 
259 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  62.79 
 
 
258 aa  318  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  63.87 
 
 
265 aa  315  5e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  58.05 
 
 
259 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  29.91 
 
 
260 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  38.93 
 
 
416 aa  79  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.46 
 
 
684 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  31.97 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  39.45 
 
 
2413 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.61 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.97 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.97 
 
 
490 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  41.59 
 
 
1402 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  35.14 
 
 
831 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  29.78 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  30.95 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.59 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.59 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.59 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  37.38 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.72 
 
 
557 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  33.04 
 
 
961 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.42 
 
 
528 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.52 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.36 
 
 
789 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  39.5 
 
 
976 aa  68.9  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.71 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  37.6 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.4 
 
 
341 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.96 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.21 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.77 
 
 
1037 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  30.54 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  37.29 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.04 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  28.65 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.8 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  35.65 
 
 
1493 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.48 
 
 
890 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.11 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  30 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  32.33 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  29.14 
 
 
376 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  30 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  36.04 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  33.65 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.29 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.65 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.19 
 
 
321 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  29.41 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  37.04 
 
 
249 aa  62.4  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.9 
 
 
731 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  34.83 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  31.58 
 
 
765 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 
838 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.83 
 
 
376 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.07 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  35.58 
 
 
117 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  38.14 
 
 
961 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  31.58 
 
 
693 aa  60.1  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  32.46 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  30.86 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  31.51 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  34.65 
 
 
380 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
343 aa  59.3  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  28.67 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  28.81 
 
 
303 aa  58.9  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  37.04 
 
 
264 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  32.39 
 
 
315 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1606  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.25 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.566545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  35.16 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.45 
 
 
1002 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 
234 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  35.16 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  35.16 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  32 
 
 
1430 aa  58.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0605  sporulation domain-containing protein  39.45 
 
 
364 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.690459  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  37.5 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>