More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0663 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  78.99 
 
 		 258 aa  424  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  67.32 
 
 		 259 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  66.93 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  66.54 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  66.15 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  62.93 
 
 		 259 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  62.93 
 
 		 259 aa  362  4e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  62.93 
 
 		 259 aa  361  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  62.65 
 
 		 259 aa  359  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  65.25 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  63.04 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  70.46 
 
 		 259 aa  347  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  60.89 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  58.14 
 
 		 258 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  61.34 
 
 		 265 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  29.8 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.39 
 
 		 831 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  38.68 
 
 		 789 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  30.48 
 
 		 684 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.93 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  39.42 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.12 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.88 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  35.59 
 
 		 961 aa  75.9  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.53 
 
 		 557 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.39 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.35 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1402 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  36.43 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  38.6 
 
 		 393 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  35.88 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  36 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.61 
 
 		 1493 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.74 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  26.21 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  28.83 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  35.2 
 
 		 327 aa  68.9  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.61 
 
 		 489 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  37.74 
 
 		 2413 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 976 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.19 
 
 		 731 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.68 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0800  Sel1 repeat-containing protein  37.17 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  26.4 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.9 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.88 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1037 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  38.04 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  26.4 
 
 		 331 aa  65.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.74 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.58 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1877 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  30.16 
 
 		 838 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  31.21 
 
 		 490 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  37.36 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  34.09 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  32.79 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1002 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  35.78 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  37.89 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 		 685 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  35.51 
 
 		 978 aa  63.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  32.74 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.26 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 1430 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  32.74 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  24.88 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.06 
 
 		 341 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  31.58 
 
 		 765 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.53 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  31.21 
 
 		 490 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  33.61 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  32.74 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  34.38 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  32.14 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0997  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.87 
 
 		 126 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.79 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.67 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  33.91 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  29.79 
 
 		 913 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  33.91 
 
 		 720 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  33.91 
 
 		 720 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  31.78 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  34.11 
 
 		 839 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.72 
 
 		 523 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.18 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  27.47 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58600  hypothetical protein  38.95 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>