More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3689 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
259 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  99.23 
 
 
259 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  99.61 
 
 
259 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  99.23 
 
 
259 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  86.87 
 
 
259 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  86.1 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  84.56 
 
 
259 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  84.94 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  84.94 
 
 
259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  66.54 
 
 
259 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  64.73 
 
 
258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  64.48 
 
 
260 aa  337  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  63.45 
 
 
259 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  63.75 
 
 
265 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  62.55 
 
 
258 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  55.64 
 
 
259 aa  298  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  30.2 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  39.19 
 
 
416 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.64 
 
 
684 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.38 
 
 
1402 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  32.65 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  37.84 
 
 
831 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  41.28 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.91 
 
 
789 aa  75.5  0.0000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  39.25 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  30.41 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  34.36 
 
 
961 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  34.76 
 
 
557 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.37 
 
 
2413 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 
976 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  38.6 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  32.65 
 
 
490 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.81 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  36.57 
 
 
271 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  32.65 
 
 
490 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  38.68 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  40.2 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.81 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  29.56 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.68 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.39 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  43.3 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.94 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  37.9 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  31.74 
 
 
325 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  37.39 
 
 
1493 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  29.17 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.09 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  29.06 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  29.17 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.5 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.9 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.9 
 
 
373 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  34.38 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.89 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  31.34 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  30.59 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
1430 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.33 
 
 
838 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.04 
 
 
482 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.14 
 
 
321 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  36.94 
 
 
1002 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.19 
 
 
1037 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  33.33 
 
 
765 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 
685 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  34.35 
 
 
839 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.6 
 
 
731 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.75 
 
 
380 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  36.27 
 
 
246 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  27.72 
 
 
376 aa  62.4  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  37.36 
 
 
233 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  36.36 
 
 
359 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  32.69 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.96 
 
 
552 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  35.38 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.26 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
890 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  39.8 
 
 
523 aa  61.6  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.83 
 
 
376 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.77 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.63 
 
 
380 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  36.96 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  33.33 
 
 
679 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  36.7 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.33 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  30.53 
 
 
978 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  31.07 
 
 
680 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  32.17 
 
 
311 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  32.32 
 
 
117 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  28.65 
 
 
342 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  33.33 
 
 
221 aa  58.9  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.89 
 
 
222 aa  58.9  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
258 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  33.64 
 
 
1877 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  35.9 
 
 
961 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>