261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3003 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3003  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000180512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3872  Sel1 domain-containing protein  62.16 
 
 		 259 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0228743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0579  Sel1 domain-containing protein  62.55 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171088  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3689  Sel1 domain protein repeat-containing protein  62.55 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.292341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3746  Sel1 domain-containing protein  62.55 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16618  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0663  Sel1 domain-containing protein  58.14 
 
 		 259 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000538554  hitchhiker  0.000142702 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0618  Sel1 domain-containing protein  62.79 
 
 		 259 aa  318  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000151187  normal  0.335089 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0625  hypothetical protein  62.4 
 
 		 259 aa  318  6e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3411  Sel1 domain-containing protein  62.79 
 
 		 259 aa  318  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.001433  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0619  Sel1 domain-containing protein  62.55 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0168047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0653  hypothetical protein  60.85 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0137344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3872  Sel1 domain-containing protein  56.98 
 
 		 258 aa  310  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000147421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3508  Sel1 domain-containing protein  61.26 
 
 		 260 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00034309  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3291  TPR repeat-containing protein  57.59 
 
 		 259 aa  299  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.107014  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3189  Sel1-like protein  61.25 
 
 		 265 aa  295  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000270269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0586  TPR repeat-containing protein  57.81 
 
 		 259 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440919  normal  0.522989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  31.73 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.8 
 
 		 684 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  39.29 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  37.38 
 
 		 961 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  34.93 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  38.6 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1037 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.56 
 
 		 490 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  36.75 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1402 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.02 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  30.69 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  28.4 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.12 
 
 		 2413 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.69 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  30.69 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  33.76 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  34.82 
 
 		 831 aa  65.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.11 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.78 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1493 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  33.76 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  37.5 
 
 		 679 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.77 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  27.78 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  27.78 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  35.78 
 
 		 329 aa  62  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0321  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.26 
 
 		 234 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  36.26 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  37.11 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.96 
 
 		 528 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  36.36 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2336  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367246  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 1430 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  34.62 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0047  Sel1 domain-containing protein  35.87 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.61 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  31.3 
 
 		 685 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  36.26 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  35.87 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 976 aa  59.3  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.57 
 
 		 838 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.07 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  35.05 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  33.93 
 
 		 731 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  32.17 
 
 		 850 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.97 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.79 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  31.78 
 
 		 373 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  31.78 
 
 		 373 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.73 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  46.58 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.15 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  35.96 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  36.26 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1002 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.21 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0176  hypothetical protein  34.07 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0165  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.321883  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1532  Sel1 domain-containing protein  35.9 
 
 		 746 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00292625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  32.14 
 
 		 720 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  32.14 
 
 		 720 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0361  hypothetical protein  33.7 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0141  hypothetical protein  34.07 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0246228  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  32.14 
 
 		 720 aa  55.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  36.26 
 
 		 365 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  32.14 
 
 		 376 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  30.58 
 
 		 348 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.25 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>