176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2933 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  100 
 
 		 559 aa  1155    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  29.41 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.9 
 
 		 596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.74 
 
 		 596 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.9 
 
 		 596 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.74 
 
 		 596 aa  200  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  27.91 
 
 		 551 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  28.8 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  28.32 
 
 		 569 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  28.29 
 
 		 553 aa  186  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  29.46 
 
 		 553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  29.46 
 
 		 553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  29.46 
 
 		 553 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  28.83 
 
 		 553 aa  183  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  26.9 
 
 		 565 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  27.21 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  26.96 
 
 		 568 aa  182  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  26.85 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  26.85 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  27.03 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  26.98 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  26.85 
 
 		 551 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 551 aa  179  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 551 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  26.99 
 
 		 552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 569 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 552 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 552 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  26.67 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  26.44 
 
 		 552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 575 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  23.53 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  23.39 
 
 		 585 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 566 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  25.18 
 
 		 566 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  24.91 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 566 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  25 
 
 		 566 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  24.73 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  24.82 
 
 		 566 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  25 
 
 		 566 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 566 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  24.55 
 
 		 566 aa  134  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.55 
 
 		 566 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  24.55 
 
 		 566 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 566 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 567 aa  133  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  22.79 
 
 		 567 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  22.79 
 
 		 567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  24.67 
 
 		 637 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  22.61 
 
 		 536 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  21.29 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  21.91 
 
 		 578 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.5 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  28.47 
 
 		 345 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.12 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.1 
 
 		 579 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  23.31 
 
 		 579 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  22.05 
 
 		 578 aa  104  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.8 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  27.47 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  27.47 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  22.8 
 
 		 579 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  21.28 
 
 		 571 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  21.58 
 
 		 578 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  21.27 
 
 		 578 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  21.27 
 
 		 578 aa  95.1  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  21.05 
 
 		 578 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  21.05 
 
 		 578 aa  94  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  26.24 
 
 		 554 aa  90.1  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 495 aa  90.1  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  20 
 
 		 555 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  30.05 
 
 		 532 aa  67  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  22.12 
 
 		 569 aa  65.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  36.84 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4029  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  26.32 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27800  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.22 
 
 		 528 aa  58.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  26.23 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3466  extracellular solute-binding protein family 5  26.39 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0853012  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  24.49 
 
 		 503 aa  57  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.02 
 
 		 532 aa  57  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1982  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 508 aa  56.6  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.204968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  25.68 
 
 		 514 aa  55.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  25.12 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  19.46 
 
 		 523 aa  54.3  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2763  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 518 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4121  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 521 aa  53.9  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 		 522 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  30.3 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  22.26 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51940  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 510 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000130332  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2756  solute-binding family 5 protein  23.27 
 
 		 539 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  29.49 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  31.61 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>