More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1496 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 493 aa  694    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 503 aa  1041    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 		 494 aa  703    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 		 493 aa  680    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 		 514 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 493 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 		 493 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 493 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 493 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 493 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 509 aa  595  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 493 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 493 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 		 509 aa  590  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 		 488 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 484 aa  485  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 506 aa  449  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 		 489 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 504 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 476 aa  402  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 492 aa  392  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 480 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 506 aa  362  7.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 492 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 482 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 507 aa  336  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 504 aa  335  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 490 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 516 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 506 aa  329  8e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 503 aa  326  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 509 aa  325  8.000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 480 aa  325  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 488 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 505 aa  323  4e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 477 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 491 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 503 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.81 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 491 aa  319  7e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 485 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 479 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 502 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 503 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 485 aa  317  3e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 502 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 		 512 aa  316  5e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 464 aa  316  7e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 495 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 485 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 		 511 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 495 aa  311  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 469 aa  312  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  36.35 
 
 		 517 aa  307  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 502 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 488 aa  306  8.000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 501 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 491 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 510 aa  303  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 491 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  40.69 
 
 		 546 aa  302  9e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 493 aa  302  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 470 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 499 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 535 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 492 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 498 aa  300  5e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 469 aa  299  8e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 496 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>