195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2882 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  76.91 
 
 
611 aa  951  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  90.41 
 
 
607 aa  1103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  90.03 
 
 
614 aa  1098  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  90.41 
 
 
607 aa  1132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  5.15921e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  98.2 
 
 
614 aa  1236  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  97.24 
 
 
614 aa  1202  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  90.58 
 
 
607 aa  1104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  97.89 
 
 
614 aa  1211  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  100 
 
 
617 aa  1266  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  72.77 
 
 
608 aa  936  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  64.5 
 
 
622 aa  838  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1649  hypothetical protein  86.08 
 
 
352 aa  607  1e-172  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  44.55 
 
 
615 aa  469  1e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  44.36 
 
 
615 aa  469  1e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  44.63 
 
 
615 aa  469  1e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  43.41 
 
 
627 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  47.74 
 
 
615 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  47.43 
 
 
628 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1650  hypothetical protein  95.11 
 
 
227 aa  452  1e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  47.23 
 
 
616 aa  452  1e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  47.64 
 
 
616 aa  455  1e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  4.81618e-06  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  47.23 
 
 
616 aa  453  1e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.02664e-05  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  47.02 
 
 
616 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.23999e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  43.75 
 
 
613 aa  445  1e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  42.68 
 
 
614 aa  446  1e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  43.08 
 
 
617 aa  442  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  42.57 
 
 
613 aa  440  1e-122  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.82029e-06  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  42.5 
 
 
602 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  45.64 
 
 
625 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  45.44 
 
 
618 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.60677e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  41.42 
 
 
624 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.99463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  42.33 
 
 
617 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  41.41 
 
 
618 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  40.78 
 
 
630 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  38.72 
 
 
625 aa  385  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  38.59 
 
 
633 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  44.77 
 
 
605 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  40.08 
 
 
628 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.65722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  36.81 
 
 
628 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  37.34 
 
 
607 aa  362  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  42.19 
 
 
636 aa  361  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  36.54 
 
 
629 aa  360  6e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  37.37 
 
 
609 aa  358  1e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  37.37 
 
 
609 aa  356  7e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  37.41 
 
 
605 aa  356  9e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  37.19 
 
 
609 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  37.19 
 
 
609 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  3.491e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  37.84 
 
 
609 aa  355  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  36.96 
 
 
609 aa  354  3e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  36.66 
 
 
611 aa  353  7e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  5.55519e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  37.72 
 
 
609 aa  353  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  4.29666e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  37.9 
 
 
609 aa  352  8e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  6.339e-11 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  37.54 
 
 
611 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  4.85801e-09 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  36.64 
 
 
616 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.86308e-06  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  37.48 
 
 
616 aa  346  8e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  35.78 
 
 
609 aa  345  2e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  36.46 
 
 
585 aa  344  3e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  37.55 
 
 
609 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  40.04 
 
 
621 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  35.48 
 
 
609 aa  340  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  35.38 
 
 
610 aa  338  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.7 
 
 
1283 aa  333  6e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  38.85 
 
 
635 aa  328  2e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  38.22 
 
 
635 aa  327  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  38.22 
 
 
635 aa  327  4e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  36.92 
 
 
639 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  34.62 
 
 
604 aa  314  3e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  38.85 
 
 
610 aa  313  4e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  37.67 
 
 
614 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  36.01 
 
 
594 aa  310  6e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  34.08 
 
 
601 aa  306  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  33.91 
 
 
601 aa  304  3e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  33.45 
 
 
601 aa  303  4e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  34.93 
 
 
602 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  33.79 
 
 
603 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  34.24 
 
 
601 aa  299  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  34.26 
 
 
589 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  33.96 
 
 
603 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  33.45 
 
 
603 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.26014e-10 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  34.82 
 
 
583 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  33.62 
 
 
603 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  35.02 
 
 
619 aa  297  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  33.79 
 
 
603 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  34.2 
 
 
587 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  33.28 
 
 
605 aa  294  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  34.67 
 
 
592 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3567  hypothetical protein  37.71 
 
 
621 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.103554  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  32.66 
 
 
595 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03305  hypothetical protein  37.06 
 
 
611 aa  288  3e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0249799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  33.53 
 
 
629 aa  283  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  32.17 
 
 
599 aa  282  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  35.11 
 
 
599 aa  282  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  31.87 
 
 
610 aa  281  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  33.75 
 
 
591 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0380  protein of unknown function DUF885  34.97 
 
 
588 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  32.41 
 
 
637 aa  280  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  32.21 
 
 
635 aa  280  8e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2356  hypothetical protein  32.86 
 
 
619 aa  279  9e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.805345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  35.43 
 
 
621 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0189  hypothetical protein  37.39 
 
 
608 aa  276  6e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>