63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1886 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1886  DNA ligase  100 
 
 		 315 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0219866  normal  0.840695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1838  DNA ligase  99.05 
 
 		 315 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1852  DNA ligase  96.83 
 
 		 315 aa  593  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2439  DNA ligase  95.53 
 
 		 309 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.488176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2268  DNA ligase  68.31 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2191  DNA ligase  68.66 
 
 		 302 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.163072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2401  DNA ligase  64.5 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.980486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1748  DNA ligase  72.08 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2204  DNA ligase  64.77 
 
 		 311 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1990  DNA ligase  57.71 
 
 		 288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2511  DNA ligase  51.03 
 
 		 291 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2639  DNA ligase  54.18 
 
 		 281 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00943925  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1484  DNA ligase  50.18 
 
 		 282 aa  276  5e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1587  DNA ligase  51.56 
 
 		 270 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  normal  0.257911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4404  DNA ligase  51.16 
 
 		 292 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1235  DNA ligase  50 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0812  DNA ligase  48.11 
 
 		 306 aa  261  8e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.35337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2019  DNA ligase  46.98 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1157  DNA ligase  48.91 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148017  normal  0.132142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3695  DNA ligase  45.23 
 
 		 295 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1995  DNA ligase  47.84 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0244293  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2712  DNA ligase  49.62 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1359  DNA ligase  50.79 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0073  DNA ligase  45.56 
 
 		 279 aa  248  7e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555561  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3497  DNA ligase  50 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03421  DNA ligase  44.72 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2739  DNA ligase  48.15 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2416  DNA ligase  45.49 
 
 		 306 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1436  DNA ligase  43.73 
 
 		 298 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0077  DNA ligase  44.49 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1148  DNA ligase  43.73 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.269751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003526  ATP-dependent DNA ligase  39.93 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2369  DNA ligase  43.64 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.815308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2761  DNA ligase  45.21 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2251  DNA ligase  45.59 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0036  DNA ligase  39.51 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1366  DNA ligase  39.77 
 
 		 284 aa  218  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.332373  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2043  DNA ligase  38.87 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000183031  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1841  DNA ligase  38.87 
 
 		 282 aa  216  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1665  DNA ligase  38.52 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0584  DNA ligase  42.28 
 
 		 272 aa  215  7e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000250691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1324  DNA ligase  41.03 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1395  DNA ligase  40.39 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.168291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0782  DNA ligase  38.46 
 
 		 275 aa  202  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.200091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1672  DNA ligase  39.93 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1796  DNA ligase (ATP)  38.29 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1225  DNA ligase  39.92 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0877468  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0465  DNA ligase  35.36 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51001  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1648  PBCV-1 DNA ligase  26.52 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.176774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  27.04 
 
 		 845 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  26.55 
 
 		 828 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  24.9 
 
 		 825 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18701  ATP-dependent DNA ligase  30.86 
 
 		 412 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18891  ATP-dependent DNA ligase  33.73 
 
 		 437 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  28.19 
 
 		 882 aa  45.8  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18701  ATP-dependent DNA ligase  31.33 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570895  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1772  ATP-dependent DNA ligase  28.92 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  28.32 
 
 		 833 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  26.28 
 
 		 831 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  28.32 
 
 		 864 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81859  DNA ligase IV  24.07 
 
 		 939 aa  43.1  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  26.59 
 
 		 833 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  35.53 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>