More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1683 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0557  AsnC family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 155 aa  175  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 160 aa  160  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 174 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  47.33 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  44 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 162 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1432  transcriptional regulator, AsnC family  48.59 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605264  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1609  transcriptional regulator, AsnC family  48.59 
 
 		 153 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  48.59 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 175 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0018  transcriptional regulator, AsnC family  39.22 
 
 		 156 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.38788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  38 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  38 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  38 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  39.47 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  38 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  38 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  38.67 
 
 		 229 aa  124  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 202 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  42.47 
 
 		 167 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  40.52 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4056  AsnC family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  41.78 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 213 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40.41 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  37.33 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 161 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 152 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  42.66 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  41.1 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 152 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05356  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  40.65 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>