More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1443 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 		 296 aa  609  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1731  dihydrodipicolinate synthase  65.19 
 
 		 291 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.527965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0517  dihydrodipicolinate synthase  65 
 
 		 292 aa  355  5.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1583  dihydrodipicolinate synthase  57.09 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.122353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  54.42 
 
 		 293 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  55.1 
 
 		 293 aa  322  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 296 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  55.1 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  54.95 
 
 		 291 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  53.42 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  53.08 
 
 		 296 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  55.25 
 
 		 294 aa  318  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1142  dihydrodipicolinate synthase  55.25 
 
 		 294 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 		 299 aa  315  5e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  55.59 
 
 		 294 aa  315  8e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  55.25 
 
 		 294 aa  311  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2542  dihydrodipicolinate synthase  53.92 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0922563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0882  dihydrodipicolinate synthase  53.92 
 
 		 295 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  51.54 
 
 		 300 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0033  dihydrodipicolinate synthase  53.58 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  52.23 
 
 		 300 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  53.74 
 
 		 293 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0124  dihydrodipicolinate synthase  52.56 
 
 		 290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.139881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0149  dihydrodipicolinate synthase  52.56 
 
 		 291 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  52.72 
 
 		 293 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0704  dihydrodipicolinate synthase  54.08 
 
 		 291 aa  301  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.55955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5061  dihydrodipicolinate synthase  51.7 
 
 		 297 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  48.14 
 
 		 294 aa  298  8e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  52.74 
 
 		 299 aa  298  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 298 aa  288  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0150  dihydrodipicolinate synthase  52.22 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.613999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4694  dihydrodipicolinate synthase  50.34 
 
 		 296 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  50.68 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  48.63 
 
 		 296 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  48.3 
 
 		 292 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 		 296 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2629  dihydrodipicolinate synthase  47.26 
 
 		 319 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.121971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  48.12 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 292 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  45.99 
 
 		 292 aa  265  5e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  47.95 
 
 		 296 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  47.12 
 
 		 293 aa  265  8.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1870  dihydrodipicolinate synthase  48.97 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.345659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  48.92 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.56 
 
 		 290 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 		 290 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  44.52 
 
 		 292 aa  255  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0847  dihydrodipicolinate synthase  46.8 
 
 		 307 aa  254  8e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  44.18 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2923  dihydrodipicolinate synthase  44.88 
 
 		 290 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 301 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  46.76 
 
 		 301 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  47.08 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  47.1 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2124  dihydrodipicolinate synthase  46.6 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.035757 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2262  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 		 296 aa  247  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  46.42 
 
 		 301 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  40.54 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1072  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  43 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  47.78 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2984  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2634  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2723  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2748  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2682  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 292 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.958571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0991  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 290 aa  245  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2379  dihydrodipicolinate synthase  43.73 
 
 		 293 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2974  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.484069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2855  dihydrodipicolinate synthase  46.26 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.239791  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02370  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2760  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3700  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2625  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02332  hypothetical protein  45.92 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3975  dihydrodipicolinate synthase  46.94 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2850  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2610  dihydrodipicolinate synthase  45.92 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  44.22 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  46.34 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  42.66 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  46.72 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1191  dihydrodipicolinate synthase  45.58 
 
 		 292 aa  243  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  44.9 
 
 		 291 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>