109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0239 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0239  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  126  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3726  hypothetical protein  49.02 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4347  hypothetical protein  44.83 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  46.3 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0908  hypothetical protein  48 
 
 		 70 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0544029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1974  hypothetical protein  48 
 
 		 70 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0330  hypothetical protein  57.14 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  48 
 
 		 52 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3352  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  47.06 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  47.06 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0869  protein of unknown function DUF1289  46 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.293603  normal  0.224383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  41.82 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1983  hypothetical protein  40.82 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  51.06 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0239  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  45.1 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000372034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  42 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2362  hypothetical protein  44.07 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0438  protein of unknown function DUF1289  41.51 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  40.43 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0865  hypothetical protein  40.35 
 
 		 64 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0084  hypothetical protein  44 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0842  protein of unknown function DUF1289  43.14 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.660965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  46.81 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4708  protein of unknown function DUF1289  41.67 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  41.82 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1102  hypothetical protein  46.51 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000721492  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0112  protein of unknown function DUF1289  42.55 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  42 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3289  protein of unknown function DUF1289  46.51 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000325627  normal  0.144194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3035  protein of unknown function DUF1289  43.4 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.468674  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3596  hypothetical protein  44.19 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  43.75 
 
 		 248 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4154  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.75 
 
 		 251 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0966  hypothetical protein  46.81 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3008  hypothetical protein  44.19 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643825  normal  0.102942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3089  hypothetical protein  44.19 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000454592  normal  0.43378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  41.51 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3754  hypothetical protein  43.4 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353082  normal  0.856634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0979  Fe-S protein-like protein  38.78 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.104856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0509  hypothetical protein  37.25 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0894  hypothetical protein  44.19 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000427519  normal  0.844163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2957  hypothetical protein  44.44 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2014  hypothetical protein  40.38 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  45.45 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2233  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0963736  normal  0.163995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1000  hypothetical protein  46.51 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000103253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1008  hypothetical protein  46.51 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000657187  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0857  hypothetical protein  38.6 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1069  hypothetical protein  46.51 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000277131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4380  hypothetical protein  47.06 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2667  protein of unknown function DUF1289  38.18 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000668221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2383  hypothetical protein  38.18 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1063  protein of unknown function DUF1289  38 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.336879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5962  hypothetical protein  38.89 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.166337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6311  hypothetical protein  42.59 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  31.48 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0259  hypothetical protein  41.82 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0935  hypothetical protein  44.19 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3009  hypothetical protein  44 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3186  hypothetical protein  41.86 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000975411  normal  0.940677 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  40.43 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  41.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2207  hypothetical protein  44.19 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000511306  hitchhiker  0.0000930327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0876  hypothetical protein  41.86 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000283508  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2739  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0856  hypothetical protein  32.65 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154874 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  41.86 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  44.68 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1028  hypothetical protein  39.58 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000119763  normal  0.108496 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2872  hypothetical protein  44 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  47.62 
 
 		 285 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  40.38 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0120  hypothetical protein  39.58 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal  0.60667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  47.62 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.78 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  40.91 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0737  hypothetical protein  39.53 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3773  protein of unknown function DUF1289  40 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0156  hypothetical protein  37.5 
 
 		 80 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003791  predicted Fe-S protein  34.88 
 
 		 82 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000736232  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3627  hypothetical protein  42.31 
 
 		 59 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  34.69 
 
 		 147 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  37.74 
 
 		 202 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1799  hypothetical protein  45.24 
 
 		 81 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000202172  normal  0.0255641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2046  hypothetical protein  42.55 
 
 		 76 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3379  protein of unknown function DUF1289  36.17 
 
 		 147 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0478  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.69 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2838  hypothetical protein  32.65 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  36.17 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01618  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000568284  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1992  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.11931e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  35.85 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0534  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.556367  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1981  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000345163  hitchhiker  0.000939338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01608  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1550  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  30.77 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>