More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0091 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  53.21 
 
 		 614 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  54.97 
 
 		 638 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.5 
 
 		 660 aa  635    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.91 
 
 		 637 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  51.03 
 
 		 647 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  53.35 
 
 		 626 aa  651    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  54.92 
 
 		 616 aa  651    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  53.47 
 
 		 608 aa  641    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  52.96 
 
 		 665 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.42 
 
 		 640 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.04 
 
 		 637 aa  637    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 625 aa  1269    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0518  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.74 
 
 		 636 aa  797    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000475149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  51.03 
 
 		 644 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.96 
 
 		 673 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.17 
 
 		 676 aa  634  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.23 
 
 		 654 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.00000888182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  50.87 
 
 		 647 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.21 
 
 		 630 aa  632  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3486  ATP-dependent metalloprotease  51.59 
 
 		 647 aa  633  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000528036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3592  ATP-dependent metalloprotease  51.43 
 
 		 647 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00319823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  52.89 
 
 		 649 aa  629  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  51.43 
 
 		 647 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000163816  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.21 
 
 		 647 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  51.12 
 
 		 647 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.89 
 
 		 650 aa  631  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.99 
 
 		 631 aa  628  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  51.67 
 
 		 660 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000182706  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.44 
 
 		 627 aa  630  1e-179  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.19 
 
 		 645 aa  631  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  51.27 
 
 		 647 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  51.43 
 
 		 647 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  53.23 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.23 
 
 		 647 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  54.44 
 
 		 658 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  53.23 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000535271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.6 
 
 		 612 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  53.23 
 
 		 647 aa  627  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.93 
 
 		 636 aa  628  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  53.23 
 
 		 647 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  53.23 
 
 		 644 aa  626  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.83 
 
 		 645 aa  627  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.19 
 
 		 764 aa  627  1e-178  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  53.28 
 
 		 639 aa  625  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  52.1 
 
 		 681 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  53.23 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4500  ATP-dependent metalloprotease  53.23 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000284191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  53.06 
 
 		 647 aa  625  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.36 
 
 		 642 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.26 
 
 		 612 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  54.11 
 
 		 651 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.32 
 
 		 671 aa  624  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  53.29 
 
 		 639 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  53.29 
 
 		 639 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  52.55 
 
 		 643 aa  622  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  52.28 
 
 		 641 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.55 
 
 		 651 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000253513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.03 
 
 		 640 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 		 652 aa  625  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2636  cell division protein FtsH  50.63 
 
 		 641 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.235612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  53.86 
 
 		 639 aa  621  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2262  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.63 
 
 		 641 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000538209  hitchhiker  0.0000000171199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.33 
 
 		 621 aa  619  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.96 
 
 		 631 aa  619  1e-176  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.03 
 
 		 640 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  53.98 
 
 		 612 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.86 
 
 		 639 aa  621  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.66 
 
 		 648 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.95 
 
 		 650 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  52.95 
 
 		 647 aa  615  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  53.36 
 
 		 641 aa  618  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.11 
 
 		 642 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.99 
 
 		 656 aa  618  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.11 
 
 		 640 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 		 634 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.57 
 
 		 641 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.11 
 
 		 642 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.68 
 
 		 635 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3196  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.49 
 
 		 643 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.766379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1770  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.03 
 
 		 651 aa  617  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.292571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  50.33 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  52.94 
 
 		 634 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.77 
 
 		 642 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.78 
 
 		 646 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.86 
 
 		 643 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.68 
 
 		 640 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.18 
 
 		 638 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.02 
 
 		 639 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.08 
 
 		 638 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.02 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1317  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.67 
 
 		 638 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  52.57 
 
 		 660 aa  613  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  52.77 
 
 		 634 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 		 640 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.3 
 
 		 630 aa  610  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  51.33 
 
 		 640 aa  610  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  52.94 
 
 		 649 aa  608  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  52.78 
 
 		 650 aa  610  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.77 
 
 		 640 aa  611  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>