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for query gene SO_4021 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  100 
 
 
396 aa  788    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  90.4 
 
 
396 aa  718    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  60 
 
 
396 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  57.58 
 
 
391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  58.44 
 
 
391 aa  444  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  57.58 
 
 
391 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  57.83 
 
 
391 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  57.32 
 
 
391 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  57.32 
 
 
391 aa  444  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  57.32 
 
 
391 aa  444  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  57.32 
 
 
391 aa  444  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  57.87 
 
 
395 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  57.32 
 
 
391 aa  444  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4235  multidrug efflux system protein MdtL  57.87 
 
 
395 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637245  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  57.87 
 
 
395 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  57.87 
 
 
395 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  57.58 
 
 
391 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  57.87 
 
 
395 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.77 
 
 
400 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  30.73 
 
 
401 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  32.94 
 
 
400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.09 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.32 
 
 
400 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.43 
 
 
402 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.75 
 
 
400 aa  150  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
401 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  29.33 
 
 
423 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  28.32 
 
 
397 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.01 
 
 
402 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.36 
 
 
402 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  30.29 
 
 
400 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.7 
 
 
400 aa  143  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 
402 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 
402 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.5 
 
 
402 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.5 
 
 
402 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.87 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.01 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.01 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.62 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.01 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.27 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 
397 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.42 
 
 
397 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.53 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30 
 
 
397 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.57 
 
 
396 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2204  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.44 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.39 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2331  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 
396 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.369879  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2370  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.95 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2572  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.95 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348003 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3320  bicyclomycin/multidrug efflux system  30 
 
 
396 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0589131  normal  0.334809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2458  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.95 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150098 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2461  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.95 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.334321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2415  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.95 
 
 
396 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0436595  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.41 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 
404 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 
394 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.98 
 
 
399 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1796  bicyclomycin/multidrug efflux system  36.05 
 
 
395 aa  113  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174211  normal  0.0404664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25 
 
 
410 aa  112  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.832459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.05 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  26.87 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.93 
 
 
402 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.45 
 
 
436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.44 
 
 
396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.16 
 
 
399 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.984629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.66 
 
 
411 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.241483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.16 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.16 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.98 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.06 
 
 
409 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  28.61 
 
 
403 aa  109  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  25.67 
 
 
407 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  26.7 
 
 
399 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1479  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.82 
 
 
370 aa  109  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 
421 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  25.67 
 
 
407 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.87 
 
 
398 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.15 
 
 
386 aa  107  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.28 
 
 
408 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.38 
 
 
389 aa  107  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.15 
 
 
400 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.21 
 
 
405 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 
399 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.632928 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.15 
 
 
434 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02112  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.55 
 
 
396 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1465  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.55 
 
 
396 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0013409  normal  0.810342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.55 
 
 
396 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122457  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.95 
 
 
421 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02071  hypothetical protein  29.55 
 
 
396 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0947796  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.5 
 
 
405 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_2480  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.55 
 
 
396 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.138563  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A2320  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.55 
 
 
396 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266963  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.86 
 
 
412 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
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