259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0071 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4864  TAP domain-containing protein  66.08 
 
 		 527 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0071  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 539 aa  1127    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4460  TAP domain-containing protein  60.38 
 
 		 533 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.726615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  66.74 
 
 		 519 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0074  TAP domain-containing protein  87.01 
 
 		 535 aa  969    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.523955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0072  TAP domain-containing protein  87.2 
 
 		 535 aa  983    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3977  TAP domain-containing protein  64.42 
 
 		 532 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.692071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0071  TAP domain-containing protein  76.56 
 
 		 538 aa  866    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0073  TAP domain protein  75.82 
 
 		 545 aa  866    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0076  TAP domain-containing protein  88.68 
 
 		 539 aa  1006    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458817 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4278  TAP domain-containing protein  76.5 
 
 		 540 aa  865    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  63.75 
 
 		 517 aa  639    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0057  TAP domain-containing protein  73.55 
 
 		 546 aa  805    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0076  TAP domain-containing protein  75.81 
 
 		 549 aa  870    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0068  peptidase S33, prolyl aminopeptidase  62.05 
 
 		 521 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3575  alpha/beta fold family hydrolase  57.05 
 
 		 507 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  37.92 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3874  TAP domain protein  33.78 
 
 		 508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02798  cysteine proteinase  35.55 
 
 		 533 aa  244  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1447  TAP domain-containing protein  31.79 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1502  proteinase  31.79 
 
 		 513 aa  224  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3801  cysteine proteinase  34.65 
 
 		 502 aa  213  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2538  TAP domain-containing protein  28.37 
 
 		 693 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2826  TAP domain-containing protein  29.14 
 
 		 688 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000578424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0270  TAP domain-containing protein  30.95 
 
 		 670 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.948991  hitchhiker  0.000175368 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  30.26 
 
 		 669 aa  183  6e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2103  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 645 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3206  TAP domain-containing protein  27.19 
 
 		 475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0123  TAP domain protein  32.67 
 
 		 656 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3647  alpha/beta fold family hydrolase  27.37 
 
 		 680 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0998  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 675 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0079  TAP domain-containing protein  25.54 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  28.61 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  27.45 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.42 
 
 		 515 aa  123  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  31.33 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0147  alpha/beta fold family hydrolase  25.3 
 
 		 668 aa  121  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.557879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2979  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.171473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0118  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742968  normal  0.120342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  26.39 
 
 		 525 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  27.01 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2436  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 		 484 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.425173  normal  0.0661487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  25.33 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  26.72 
 
 		 533 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  26.72 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  26.72 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  26.08 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  26.08 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  26.08 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2145  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.34 
 
 		 499 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  25.76 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  26.3 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  27.27 
 
 		 564 aa  101  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 		 489 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  24.8 
 
 		 571 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  26.6 
 
 		 485 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  25.89 
 
 		 506 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  24.76 
 
 		 518 aa  97.1  7e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  25.86 
 
 		 516 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  27.71 
 
 		 508 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  27.86 
 
 		 504 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  24.7 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  28.35 
 
 		 505 aa  94.7  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  27.34 
 
 		 505 aa  94.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  25.06 
 
 		 507 aa  94  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  24.65 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2321  TAP domain-containing protein  24.11 
 
 		 612 aa  92.8  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279811  normal  0.349466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  25.45 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.62 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  26.51 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  24.94 
 
 		 523 aa  91.3  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  31.73 
 
 		 545 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  24.39 
 
 		 547 aa  90.5  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 		 555 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  25.06 
 
 		 527 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  25.53 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.73 
 
 		 478 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  23.91 
 
 		 515 aa  89.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  24.06 
 
 		 556 aa  88.2  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  23.78 
 
 		 522 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  26.94 
 
 		 499 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  26.51 
 
 		 750 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  27.76 
 
 		 505 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  22.44 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  26.32 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  24.13 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  24.17 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25.64 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  25.74 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  32.81 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  24.22 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  25.54 
 
 		 538 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  26.76 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  29.18 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  25.59 
 
 		 643 aa  80.9  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  28.07 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  27.42 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  26.38 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>