172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2658 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  100 
 
 		 416 aa  854    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  68.19 
 
 		 415 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  67.5 
 
 		 414 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  63.93 
 
 		 397 aa  531  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  63.26 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  65.59 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  59.1 
 
 		 410 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  61.84 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  61.84 
 
 		 417 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  61.84 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  60.6 
 
 		 408 aa  508  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  61.93 
 
 		 418 aa  505  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  64.34 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  58.06 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  62.32 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  58.21 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  58.21 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  58.21 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  58.71 
 
 		 410 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  60.38 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  57.29 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  57.36 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  59.58 
 
 		 411 aa  492  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  56.47 
 
 		 409 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  56.5 
 
 		 410 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  56.75 
 
 		 409 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  57.86 
 
 		 410 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  57.78 
 
 		 410 aa  481  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  57 
 
 		 409 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  58.15 
 
 		 410 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  56.36 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  56.36 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  58.35 
 
 		 408 aa  474  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  56.47 
 
 		 409 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  56.75 
 
 		 409 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  56.25 
 
 		 410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  56.86 
 
 		 409 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  56.61 
 
 		 409 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  56.25 
 
 		 409 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  53.54 
 
 		 451 aa  453  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  54.66 
 
 		 411 aa  441  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  51.52 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  51.16 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.117842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  50 
 
 		 401 aa  356  2.9999999999999997e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  62.5 
 
 		 206 aa  251  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  40.1 
 
 		 393 aa  229  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  35.53 
 
 		 388 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  30.95 
 
 		 459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  31.85 
 
 		 322 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.11 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  30.85 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.63 
 
 		 319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.63 
 
 		 319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  29.95 
 
 		 312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  31.83 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  29.41 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  30.16 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  29.52 
 
 		 313 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  33.45 
 
 		 224 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  28 
 
 		 314 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  28.07 
 
 		 314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  29.32 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  31.44 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  29.03 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  29.03 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  29.45 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.89 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  28.36 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  29.77 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.89 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.89 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  29.7 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  28.21 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  27.97 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  29.1 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  25.44 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  25.73 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  26.32 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  35.94 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  26.35 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  26.35 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  27.76 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  29.08 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  25.15 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  28.53 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  26.02 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  27.07 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  27.05 
 
 		 329 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  24.85 
 
 		 304 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  24.85 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  26.05 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.42 
 
 		 791 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  30.18 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  26.91 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  32 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  25 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  26.22 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  27.94 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  32.58 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  28 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>