More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2328 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 433 aa  884    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  50.97 
 
 		 463 aa  431  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  43.88 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  46 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  43.64 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  44.76 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  43.78 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  46.19 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  47.06 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  43.38 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  43.47 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  46.1 
 
 		 416 aa  358  8e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  45.1 
 
 		 611 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  42.65 
 
 		 441 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  44.07 
 
 		 454 aa  356  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  43.14 
 
 		 440 aa  352  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  43.98 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  42.2 
 
 		 436 aa  350  4e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  45.1 
 
 		 440 aa  348  8e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 437 aa  348  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  42.45 
 
 		 446 aa  345  8e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  45.26 
 
 		 414 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  41.29 
 
 		 433 aa  336  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  39.56 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 395 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 395 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  39.8 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  40.05 
 
 		 406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0105  GntR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 411 aa  302  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 409 aa  302  9e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 402 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  40.2 
 
 		 402 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  38.52 
 
 		 396 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  39.69 
 
 		 404 aa  293  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  38.42 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  37.81 
 
 		 397 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2741  putative transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.343456 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 413 aa  290  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  37.93 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1955  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479896  normal  0.0640255 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  38.12 
 
 		 410 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  38.1 
 
 		 399 aa  286  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  38.12 
 
 		 410 aa  285  9e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 401 aa  285  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  39.44 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.41 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0315  putative transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.665801  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  40.71 
 
 		 377 aa  282  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  36.45 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  38.42 
 
 		 393 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  38.42 
 
 		 393 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  38.42 
 
 		 393 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  38.42 
 
 		 393 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  38.42 
 
 		 393 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  40.59 
 
 		 402 aa  279  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  38.42 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 393 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 393 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 393 aa  279  8e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2486  putative transcriptional regulator, GntR family  38.21 
 
 		 406 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.95 
 
 		 393 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0592  putative transcriptional regulator, GntR family  38.23 
 
 		 411 aa  278  2e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  37.1 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0110  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 411 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1680  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 411 aa  272  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.733042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2084  aminotransferase, class I and II  39.76 
 
 		 406 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  33.84 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1614  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  37.03 
 
 		 407 aa  266  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1681  putative transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 406 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 386 aa  262  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  37.16 
 
 		 420 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 395 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  38.25 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 425 aa  259  9e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>