More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1318 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  59.2 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  57.66 
 
 		 251 aa  296  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  57.14 
 
 		 253 aa  293  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  56.45 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  57.2 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  57.96 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  55.02 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  56.05 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  56.85 
 
 		 247 aa  284  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  56.57 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  56 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  54.44 
 
 		 247 aa  280  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  56.5 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  54.03 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  53.23 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  54.03 
 
 		 247 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  55.78 
 
 		 250 aa  278  7e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  53.66 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  54.03 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  56.45 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  56.45 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  52.38 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  54.84 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  53.82 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  52.82 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  52.21 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  54.44 
 
 		 251 aa  275  6e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  53.6 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  53.6 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  53.6 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  57.02 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  53.2 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  54.8 
 
 		 249 aa  271  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  55.1 
 
 		 247 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  54.92 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  54.03 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  52.02 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  54.62 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  54.69 
 
 		 247 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  53.63 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  53.25 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  53.82 
 
 		 251 aa  268  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  53.41 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  53.23 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  52.21 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  51.6 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  51.21 
 
 		 250 aa  265  4e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  51.64 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  53.25 
 
 		 243 aa  263  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  52.57 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  52.85 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  53.01 
 
 		 248 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  54.22 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  53.23 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.6 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.21 
 
 		 247 aa  261  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  55.65 
 
 		 250 aa  260  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  54.84 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  50.8 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  53.69 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  51.82 
 
 		 249 aa  259  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  54.44 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  51.44 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  49.2 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  51.03 
 
 		 246 aa  258  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  257  9e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  53.41 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  49 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  48.96 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  55.28 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  55.28 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  50.59 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  55.28 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  51.21 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  51 
 
 		 253 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0967  protein of unknown function DUF28  49.62 
 
 		 266 aa  252  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.021533  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  51.41 
 
 		 248 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  51.63 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  54.88 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  52.03 
 
 		 251 aa  251  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  52.42 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  50.4 
 
 		 249 aa  251  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  51.64 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  53.01 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  50.82 
 
 		 243 aa  250  2e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  55.02 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  50.4 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  50.6 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  52.61 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  50.41 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  52.61 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1665  protein of unknown function DUF28  53.97 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0741834  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  52.61 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  53.01 
 
 		 248 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  53.01 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  50.2 
 
 		 252 aa  247  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>