More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2034 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2304  hypothetical protein  90.84 
 
 
251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0897914  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12910  conserved hypothetical protein TIGR01033  70.36 
 
 
253 aa  353  2e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.335721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  68.65 
 
 
252 aa  349  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  69.88 
 
 
250 aa  347  8e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  69.88 
 
 
250 aa  347  8e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  69.88 
 
 
250 aa  347  8e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  69.35 
 
 
249 aa  346  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  68.13 
 
 
251 aa  345  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  68.13 
 
 
251 aa  343  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  68.53 
 
 
252 aa  343  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  67.74 
 
 
249 aa  340  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  66.93 
 
 
253 aa  339  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  68.53 
 
 
251 aa  339  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  65.74 
 
 
251 aa  334  9e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  66.14 
 
 
251 aa  332  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  66.13 
 
 
249 aa  332  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  66.4 
 
 
250 aa  331  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  63.92 
 
 
255 aa  331  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  65.32 
 
 
250 aa  330  9e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  67.07 
 
 
249 aa  330  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  67.76 
 
 
250 aa  329  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  65.34 
 
 
251 aa  329  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  66.26 
 
 
248 aa  328  4e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  66.93 
 
 
251 aa  328  7e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  67.73 
 
 
251 aa  327  8e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  65.32 
 
 
254 aa  323  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  64.52 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  63.31 
 
 
249 aa  318  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  64.94 
 
 
251 aa  318  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  64.23 
 
 
251 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  62.16 
 
 
259 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  61.69 
 
 
252 aa  310  1e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  62.15 
 
 
251 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1665  protein of unknown function DUF28  61.57 
 
 
256 aa  299  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0741834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  55.78 
 
 
251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  53.78 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  51.81 
 
 
252 aa  249  2e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  44.26 
 
 
249 aa  234  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  46.22 
 
 
250 aa  232  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  45.38 
 
 
250 aa  228  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  46 
 
 
250 aa  228  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  46.22 
 
 
250 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  48.16 
 
 
243 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  47.37 
 
 
250 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  46.61 
 
 
250 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  48.77 
 
 
249 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  45.16 
 
 
246 aa  223  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  46.18 
 
 
247 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  46.09 
 
 
247 aa  222  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.22 
 
 
248 aa  222  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  47.35 
 
 
250 aa  222  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  45.67 
 
 
253 aa  222  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  46.09 
 
 
247 aa  221  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  46.09 
 
 
246 aa  221  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  46.22 
 
 
248 aa  221  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  47.81 
 
 
247 aa  221  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  46 
 
 
250 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.01 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  44.58 
 
 
247 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  46.84 
 
 
247 aa  218  6e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.2 
 
 
250 aa  217  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.2 
 
 
250 aa  217  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  46.59 
 
 
248 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  47.01 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  44.86 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  45.63 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  47.18 
 
 
246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  46.53 
 
 
244 aa  215  5e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  46.53 
 
 
244 aa  215  5e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  44.4 
 
 
248 aa  215  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0323  protein of unknown function DUF28  42.64 
 
 
265 aa  215  5e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125354  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  43.43 
 
 
250 aa  215  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  46 
 
 
247 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  44.86 
 
 
247 aa  214  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  42.97 
 
 
249 aa  214  8e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  43.78 
 
 
250 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  46.03 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  43.44 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  44.49 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  44.72 
 
 
250 aa  211  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  43.44 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  44 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  44 
 
 
246 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  43.03 
 
 
251 aa  211  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  45.42 
 
 
248 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  43.6 
 
 
246 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>