More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0323 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0323  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03900  conserved hypothetical protein TIGR01033  73.96 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.144849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07020  conserved hypothetical protein TIGR01033  69.66 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000405153  normal  0.306564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0967  protein of unknown function DUF28  69.17 
 
 		 266 aa  376  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.021533  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  46.42 
 
 		 251 aa  228  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  49.24 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  48.85 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  44.91 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  47.23 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  49.06 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  44.87 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  44.57 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  44.66 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  44.15 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  45.06 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  46.01 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  45.63 
 
 		 246 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  43.4 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  42.75 
 
 		 250 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  45.63 
 
 		 246 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  45.25 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  44.11 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  45.25 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  45.25 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  45.25 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  45.25 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  45.25 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  44.87 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  44.87 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  44.87 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  44.87 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  42.64 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  43.08 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  46.01 
 
 		 248 aa  215  7e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  43.61 
 
 		 253 aa  215  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  42.8 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  43.73 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  45.8 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  42.64 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  44.91 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2304  hypothetical protein  42.64 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0897914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  46.18 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  41.51 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  43.08 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  44.49 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  43.08 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  42.37 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  43.18 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  43.18 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  43.18 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  43.51 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  43.73 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  43.8 
 
 		 249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  44.02 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  45.63 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  41.98 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  43.56 
 
 		 253 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  41.92 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  43.58 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  42.97 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  45.66 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  45.66 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  41.83 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  42.69 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  44.87 
 
 		 249 aa  209  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  42.75 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  44.19 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  42.59 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  45.59 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  39.92 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  42.69 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  44.49 
 
 		 247 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  43.56 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  44.27 
 
 		 250 aa  208  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  46.43 
 
 		 243 aa  207  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  43.25 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  43.73 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  44.36 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  43.77 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  43.19 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  43.4 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  42.29 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  43.35 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  45.42 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  40.86 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  44.11 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  45.08 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  45.28 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  42.97 
 
 		 247 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  44.87 
 
 		 248 aa  205  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  45.45 
 
 		 248 aa  205  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  43.73 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  42.97 
 
 		 247 aa  204  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  45.45 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  40.86 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  43.56 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  44.91 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  41.57 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  44.88 
 
 		 249 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  42.41 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>