More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2304 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0897914  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  90.84 
 
 		 251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  70.68 
 
 		 250 aa  354  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  70.68 
 
 		 250 aa  354  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  70.68 
 
 		 250 aa  354  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  68.92 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  69.32 
 
 		 251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  68.53 
 
 		 251 aa  349  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12910  conserved hypothetical protein TIGR01033  69.72 
 
 		 253 aa  347  8e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.335721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  67.6 
 
 		 252 aa  344  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  67.34 
 
 		 249 aa  344  7e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  67.87 
 
 		 251 aa  343  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  68.53 
 
 		 251 aa  340  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  67.2 
 
 		 250 aa  339  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  66.13 
 
 		 249 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  67.89 
 
 		 249 aa  337  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  64.92 
 
 		 250 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  68.53 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  64.31 
 
 		 255 aa  335  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  68.57 
 
 		 250 aa  334  7e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  66.27 
 
 		 252 aa  334  9e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  65.32 
 
 		 249 aa  333  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  67.34 
 
 		 254 aa  332  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  66.14 
 
 		 251 aa  331  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  64.14 
 
 		 251 aa  331  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  64.52 
 
 		 249 aa  328  7e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  64.63 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  63.35 
 
 		 251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  63.71 
 
 		 249 aa  324  8.000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  64.54 
 
 		 251 aa  323  1e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  61.78 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  62.6 
 
 		 251 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  60.89 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  62.2 
 
 		 251 aa  307  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1665  protein of unknown function DUF28  60 
 
 		 256 aa  298  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0741834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  54.62 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  54.98 
 
 		 251 aa  260  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  52.61 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  47.41 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  46.4 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  48.78 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  43.85 
 
 		 249 aa  231  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  47.41 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  46.99 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  46.61 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  46.56 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  48.16 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  45.38 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  48.36 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  46.83 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  45.97 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  45.6 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  45.68 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  46.5 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  47.41 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  46.46 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  46.5 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.6 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.6 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  45.68 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  46.53 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  48.21 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  45.02 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  45.45 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  45.68 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  42.97 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  44.58 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  46.12 
 
 		 244 aa  218  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  46.12 
 
 		 244 aa  218  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  45.71 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  44.44 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  46.59 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  45.31 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  44.98 
 
 		 250 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  45.6 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  44.8 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  44.8 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  44.03 
 
 		 247 aa  214  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  44.26 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  44.4 
 
 		 246 aa  214  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  44.8 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  44.8 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  45.82 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  45.42 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  46.03 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  45.42 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>