More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0081 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 533 aa  1048    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 340 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.4 
 
 		 336 aa  167  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  41.86 
 
 		 348 aa  160  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  37.73 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.88 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  41.85 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.19 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  38.63 
 
 		 362 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  39.72 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  38.4 
 
 		 339 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 333 aa  154  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  43.24 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1873  LacI family response repressor  39.06 
 
 		 368 aa  152  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.845568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.19 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 342 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  36.05 
 
 		 341 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  39.83 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  34.15 
 
 		 337 aa  147  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  33.46 
 
 		 333 aa  146  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  40.09 
 
 		 344 aa  146  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 342 aa  146  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.4 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.4 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.4 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.4 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.4 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 332 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.41 
 
 		 330 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  38.2 
 
 		 355 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  38.29 
 
 		 334 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.62 
 
 		 339 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 344 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  44.85 
 
 		 331 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  35.56 
 
 		 335 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  43.81 
 
 		 379 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.29 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  39.58 
 
 		 335 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  38.01 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  40.72 
 
 		 350 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.71 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.29 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  39.13 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.31 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.31 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.31 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6713  transcriptional regulator, LacI family  39.32 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.781502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.31 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  34.31 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4741  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.07 
 
 		 350 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.89 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.31 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  35.94 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.31 
 
 		 343 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.22 
 
 		 347 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.31 
 
 		 330 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.21 
 
 		 335 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  39.24 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  28.18 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  42.86 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.7 
 
 		 334 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 340 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 351 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.34 
 
 		 335 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.48 
 
 		 341 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 333 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  33.45 
 
 		 336 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  40.82 
 
 		 341 aa  136  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0113  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  32.96 
 
 		 334 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  37.07 
 
 		 339 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  37.92 
 
 		 347 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2475  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000232076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  29.36 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  33.62 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  32.45 
 
 		 330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 338 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  42.7 
 
 		 336 aa  134  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2373  LacI family transcription regulator  39.59 
 
 		 346 aa  134  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  40.08 
 
 		 349 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  47.02 
 
 		 338 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.94 
 
 		 343 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.52 
 
 		 343 aa  134  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.57 
 
 		 343 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.57 
 
 		 343 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.58 
 
 		 341 aa  134  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  39.24 
 
 		 340 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 343 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 346 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.03 
 
 		 338 aa  133  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 342 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  40.78 
 
 		 337 aa  133  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  33.57 
 
 		 343 aa  133  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 		 342 aa  133  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>