195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3977 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  877    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  56.14 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  52.78 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  52.28 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.2 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.21 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  44.19 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  46.03 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.75 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  47.5 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  40.14 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  44.74 
 
 		 452 aa  360  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  39.41 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  46.97 
 
 		 442 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  44.93 
 
 		 462 aa  317  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.31 
 
 		 454 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  44.67 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  41.22 
 
 		 457 aa  302  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  41.22 
 
 		 457 aa  302  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.3 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  42.01 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.76 
 
 		 435 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  42.48 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  45.43 
 
 		 438 aa  291  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  41.01 
 
 		 438 aa  289  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  46.85 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  40 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  43.84 
 
 		 438 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  41.78 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.89 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  43.16 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.53 
 
 		 433 aa  282  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  42.51 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  43.96 
 
 		 432 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  42.43 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.62 
 
 		 447 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  42.64 
 
 		 455 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  38.11 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.11 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.11 
 
 		 456 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  39.41 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.95 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  38.57 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.97 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  32.57 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.33 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  35.18 
 
 		 476 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.65 
 
 		 441 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 474 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  30.56 
 
 		 431 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  29.9 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.34 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  35.34 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  35.34 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  35.34 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  35.34 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  34.48 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  34.48 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  34.48 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.48 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  34.48 
 
 		 478 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  34.48 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27.42 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  35.06 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  35.15 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 481 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  32.73 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7151  FAD linked oxidase-like protein  30.82 
 
 		 452 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591549  normal  0.0143598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  24.94 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2434  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.61 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  26.53 
 
 		 578 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.62 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  32.08 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  23.84 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1468  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.93 
 
 		 484 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  31.13 
 
 		 424 aa  53.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1007  FAD linked oxidase domain protein  32.3 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1780  FAD linked oxidase domain protein  30.38 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000119799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1284  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.14 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0955  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1357  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  22.5 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000325772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5531  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.43 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.29 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.28 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 983 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2534  FAD linked oxidase domain protein  28.49 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  28.18 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1591  twin-arginine translocation pathway signal  31.86 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.190202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  20.15 
 
 		 481 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0925  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0825  FAD linked oxidase-like  31.25 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.360553  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  26.85 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5005  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.32 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.205083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0429  FAD linked oxidase domain protein  30.51 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  22.65 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  22.65 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  22.65 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>