More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1007 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1007  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
445 aa  858    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4473  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.01 
 
 
450 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.137525 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10162  oxidoreductase  36.51 
 
 
449 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2018  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 
451 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.633702  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2081  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.76 
 
 
451 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2035  FAD linked oxidase-like protein  35.76 
 
 
451 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1374  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.89 
 
 
473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1334  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.89 
 
 
473 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0542  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.84 
 
 
464 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1790  FAD linked oxidase-like protein  31.66 
 
 
470 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624763  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2621  oxidoreductase, FAD-binding  30.44 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.6474  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3053  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 
481 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0971  FAD linked oxidase-like  30 
 
 
473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.18122  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20192  d-lactate dehydrogenase  29.76 
 
 
507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1453  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4598  FAD linked oxidase-like  29.78 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347374  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1431  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.22 
 
 
473 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488984  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6532  FAD linked oxidase domain protein  31.85 
 
 
463 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5293  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.03 
 
 
464 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4851  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.03 
 
 
472 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 
458 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1862  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 
472 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258357  hitchhiker  0.0000244132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1989  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.41 
 
 
465 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1578  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 
475 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2091  FAD linked oxidase-like  32.08 
 
 
471 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2401  FAD linked oxidase domain protein  32.52 
 
 
468 aa  168  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1128  FAD linked oxidase-like protein  28.22 
 
 
474 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0322284  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1266  FAD linked oxidase domain protein  30.02 
 
 
475 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5154  FAD linked oxidase domain protein  27.7 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0723  FAD linked oxidase-like protein  27.48 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0368  putative oxidoreductase, FAD binding  27.48 
 
 
480 aa  167  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0898  FAD linked oxidase-like  27.25 
 
 
485 aa  167  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0908186  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.06 
 
 
463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11045  actin interacting protein 2 (AFU_orthologue; AFUA_5G02230)  27.03 
 
 
557 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000745867  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4322  FAD linked oxidase-like  31.47 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.163811 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0409  FAD linked oxidase-like  27.7 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1307  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.96 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2776  FAD linked oxidase domain protein  32.43 
 
 
472 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1817  putative oxidoreductase  31.57 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0138  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.48 
 
 
506 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.529634  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2386  putative D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase  30.93 
 
 
475 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0617149  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5207  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.93 
 
 
465 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345841  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0568  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.96 
 
 
504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0410  hypothetical protein  26.95 
 
 
464 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.622003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3047  FAD linked oxidase domain protein  30.7 
 
 
489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.517001 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0307  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 
479 aa  163  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3631  FAD linked oxidase domain protein  36.32 
 
 
465 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.353747  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1704  oxidoreductase, FAD-binding  29.95 
 
 
473 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0939  oxidoreductase, FAD-binding  29.95 
 
 
473 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1472  oxidoreductase, FAD-binding  29.95 
 
 
473 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1859  oxidoreductase, FAD-binding  29.95 
 
 
524 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0409  oxidoreductase, FAD-binding  29.95 
 
 
473 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4846  FAD linked oxidase domain protein  31.79 
 
 
470 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0121989  normal  0.0357013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1351  putative FAD-binding oxidoreductase  31.71 
 
 
472 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652696  normal  0.185636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2071  FAD linked oxidase-like  31.53 
 
 
469 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.840196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0753  oxidoreductase, FAD-binding  29.95 
 
 
473 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.78628  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5061  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.25 
 
 
473 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2016  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.11 
 
 
474 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01750  D-lactate dehydrogenase (cytochrome), putative  30.32 
 
 
568 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2750  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  29.53 
 
 
468 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.603945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04140  hypothetical protein  26.5 
 
 
464 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2518  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 
483 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0770  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 
471 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.913488 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1339  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.33 
 
 
462 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00404666  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1131  FAD linked oxidase-like  31.15 
 
 
475 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1406  oxidoreductase  29.11 
 
 
462 aa  159  8e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.129812  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1682  oxidoreductase, FAD-binding  29.73 
 
 
473 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0311  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.8 
 
 
473 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.126131 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3631  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.42 
 
 
463 aa  159  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5112  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.47 
 
 
467 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111989  normal  0.0276244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1247  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  28.79 
 
 
472 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0982  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.78 
 
 
472 aa  159  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48310  FAD linked oxidoreductase  27.58 
 
 
463 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1744  FAD linked oxidase-like protein  28.76 
 
 
484 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01540  conserved hypothetical protein  25.92 
 
 
537 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.527687  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3758  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 
480 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3784  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 
472 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1468  FAD linked oxidase domain protein  31.93 
 
 
487 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412211  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1452  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.96 
 
 
480 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332175  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  30.34 
 
 
472 aa  157  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1668  FAD linked oxidase domain protein  29.09 
 
 
477 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2213  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 
469 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1246  FAD linked oxidase-like  29.96 
 
 
489 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1998  oxidoreductase, FAD-binding  32.02 
 
 
460 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0733  FAD linked oxidase domain protein  30.87 
 
 
478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0806943 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1828  FAD linked oxidase-like  30.09 
 
 
473 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514065 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2934  FAD linked oxidase-like  32.7 
 
 
476 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0121  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.7 
 
 
476 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4231  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.01 
 
 
463 aa  156  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.48 
 
 
476 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0480  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.19 
 
 
477 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1556  oxidoreductase protein  31.74 
 
 
470 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.94486 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21430  FAD linked oxidoreductase  29.75 
 
 
472 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2895  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.65 
 
 
457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0604717  normal  0.268779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1997  FAD linked oxidase domain protein  28.29 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810162  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5048  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.98 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43218  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2697  FAD linked oxidase  28.64 
 
 
480 aa  154  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89565  mitochondrial D-lactate dehydrogenase  27.21 
 
 
523 aa  153  5.9999999999999996e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2184  FAD linked oxidase domain protein  32.05 
 
 
481 aa  153  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.090594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 
462 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.546012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>