More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4318 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 305 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 305 aa  584  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  65.53 
 
 		 309 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.82 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  65.71 
 
 		 287 aa  318  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.74 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  57.39 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.45 
 
 		 301 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  55.03 
 
 		 300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  55.48 
 
 		 319 aa  275  8e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  60.14 
 
 		 301 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  54.1 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  53.97 
 
 		 331 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  53.97 
 
 		 331 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  53.85 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  53.31 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  54.18 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  52.25 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  54.14 
 
 		 312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  53.63 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  53.88 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  53.88 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  53.88 
 
 		 268 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  52.52 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3416  hypothetical protein  59.26 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 		 286 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  37.62 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  37.62 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  35.33 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  35.33 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  35.33 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  35.84 
 
 		 297 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  34.75 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  35.86 
 
 		 299 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  33.67 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  33.67 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  33.67 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  36.5 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  35.47 
 
 		 336 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1873  hypothetical protein  41.01 
 
 		 307 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  33 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  30.13 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  34.98 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  30.13 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  32.04 
 
 		 306 aa  122  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  32.88 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  37.23 
 
 		 301 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  35.5 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  37.09 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.89 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  32.56 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  30.79 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.1 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  31.56 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  35.57 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  32.31 
 
 		 316 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  30.58 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.04 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  25.94 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.33 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  31.41 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.2 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.2 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  31.47 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  31.42 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.37 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  29.11 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  34.6 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  34.71 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.42 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 330 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.55 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  31.14 
 
 		 288 aa  81.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.03 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.7 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  25.48 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  23.84 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  23.76 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  23.76 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  23.4 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  30.07 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  24.26 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  23.76 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  29.6 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  31.1 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.15 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  31.23 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  22.81 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.92 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>