More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3360 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4146  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  94.73 
 
 		 493 aa  923    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0502455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 493 aa  992    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1531  FAD linked oxidase domain protein  72.23 
 
 		 482 aa  703    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1529  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  58.33 
 
 		 876 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.212638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  49.03 
 
 		 483 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  49.13 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.22 
 
 		 481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  48.37 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  47.21 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2260  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.87 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.034873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3271  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.05 
 
 		 482 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000349626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1138  D-lactate dehydrogenase  47.97 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.588849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2833  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.28 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0276  glycolate oxidase subunit GlcD  47.53 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2532  FAD linked oxidase domain protein  49.25 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06971  putative glycolate oxidase subunit glcD  46.5 
 
 		 491 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.25 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1664  glycolate oxidase subunit GlcD  45.09 
 
 		 489 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.922134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0660  putative glycolate oxidase subunit GlcD  47.02 
 
 		 483 aa  418  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.883034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0991  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.76 
 
 		 497 aa  418  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0782856  normal  0.327269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  45.4 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3047  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.22 
 
 		 488 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.767313  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1700  putative glycolate oxidase subunit GlcD  46.96 
 
 		 483 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.32321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2867  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49.22 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.52 
 
 		 497 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.84 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2953  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  49 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.094701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2921  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50 
 
 		 497 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0682  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.64 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.325958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1827  FAD linked oxidase-like  43.74 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.049746  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  43.31 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  47.39 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.84 
 
 		 495 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  43.74 
 
 		 492 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5973  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  48.28 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  43.84 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2520  glycolate oxidase subunit GlcD  44.26 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.855271  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0495  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.09 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  43.38 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.37 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1695  FAD linked oxidase domain protein  43.63 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.84126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1501  glycolate oxidase, GlcD subunit  43.87 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0901528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1870  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.47 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.200444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1268  FAD linked oxidase domain protein  45.78 
 
 		 497 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.7 
 
 		 890 aa  397  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  43.46 
 
 		 497 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1665  glycolate oxidase, subunit GlcD  46.36 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.121595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2159  glycolate oxidase subunit GlcD  43.66 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2219  glycolate oxidase subunit GlcD  43.33 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.165204  hitchhiker  0.00964982 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2037  FAD linked oxidase domain protein  44.56 
 
 		 503 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.159157  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4799  FAD linked oxidase domain protein  45.86 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374419  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5491  glycolate oxidase subunit GlcD  44.28 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  hitchhiker  0.000688169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43330  glycolate oxidase subunit GlcD  43.04 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2306  glycolate oxidase subunit GlcD  43.04 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4582  FAD linked oxidase domain protein  43.64 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000242662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.97 
 
 		 887 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5643  glycolate oxidase subunit GlcD  42.71 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.170782  normal  0.475418 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1362  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.14 
 
 		 488 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0394  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.74 
 
 		 479 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0534989  normal  0.413776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1899  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.56 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0364  FAD linked oxidase-like  42.64 
 
 		 498 aa  392  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6392  glycolate oxidase subunit GlcD  42.92 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4938  glycolate oxidase subunit GlcD  44.47 
 
 		 499 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.408162  normal  0.0595953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7454  glycolate oxidase subunit GlcD  42.71 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.108738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3257  glycolate oxidase subunit GlcD  42.83 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3033  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.98 
 
 		 477 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.491318  normal  0.0473445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0450  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.52 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0033  glycolate oxidase subunit GlcD  43.84 
 
 		 499 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2018  glycolate oxidase subunit GlcD  43.91 
 
 		 499 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0490  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.88 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.450377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5003  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  46.03 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4399  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.14 
 
 		 484 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177563  normal  0.114484 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02848  glycolate oxidase subunit, FAD-linked  42.62 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139975  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0717  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.83 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3745  glycolate oxidase subunit GlcD  43.49 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2550  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.36 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0180  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.52 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.74675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0494  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  44.52 
 
 		 479 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.159289 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1650  glycolate oxidase subunit D  43.29 
 
 		 492 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.054636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02798  hypothetical protein  42.62 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.160001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2202  glycolate oxidase subunit GlcD  43.19 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0997  FAD linked oxidase domain protein  46.43 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1885  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.51 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78076  hitchhiker  0.00459775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3439  glycolate oxidase subunit GlcD  42.83 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0721  glycolate oxidase subunit GlcD  42.83 
 
 		 499 aa  385  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3152  glycolate oxidase subunit GlcD  42.83 
 
 		 496 aa  385  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3304  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.95 
 
 		 490 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.563604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3555  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.83 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2514  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.17 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2219  glycolate oxidase subunit GlcD  43.24 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000941234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0161  glycolate oxidase, subunit GlcD  42.52 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0407483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2896  FAD-binding oxidoreductase/transferase  43.29 
 
 		 480 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0173  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.78 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2926  FAD linked oxidase-like protein  42.07 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70690  glycolate oxidase subunit GlcD  43.19 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3010  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.52 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1192  glycolate oxidase, subunit GlcD  44.15 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6132  glycolate oxidase subunit GlcD  44.25 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0221  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.14 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.120176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0208  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.52 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.23565 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>