More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1720 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 377 aa  758    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  85.99 
 
 		 374 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  55.65 
 
 		 624 aa  364  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  55.93 
 
 		 679 aa  353  4e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  48.15 
 
 		 616 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  49.44 
 
 		 359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  49.72 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  44.82 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  32.7 
 
 		 1219 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 725 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  31.68 
 
 		 1644 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  31.68 
 
 		 1644 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  33.82 
 
 		 856 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4003  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 		 545 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.351709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 1233 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  33.89 
 
 		 1635 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  30.64 
 
 		 916 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 791 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2351  hypothetical protein  29.73 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0743287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 404 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  30.46 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 389 aa  97.8  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 		 3301 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 1386 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1232 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5190  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 671 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00612346  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 		 774 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 1044 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4195  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 873 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  28.99 
 
 		 759 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 3145 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3816  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 995 aa  76.3  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  26.87 
 
 		 787 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  25.43 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4941  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 414 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3791  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242824  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1293  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4120  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 		 623 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2478  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 867 aa  68.6  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  35.19 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  23.59 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  37.39 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  26.18 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  32.79 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1975  glycosyl transferase group 1  34.23 
 
 		 763 aa  64.3  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.422047  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2706  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 930 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.95 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  52.83 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1898  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.9 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.33 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0847  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  28.88 
 
 		 816 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.82 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  35.43 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 		 816 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0179  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.203748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  33.08 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2903  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 827 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0301322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.4 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  38.1 
 
 		 859 aa  60.1  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 860 aa  60.1  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  35.1 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1996  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  22.66 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  42.47 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  29.77 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  33.33 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0757  glycosyl transferase group 1  38.64 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3474  glycosyl transferases group 1 protein  29 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.649202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 386 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>