24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3834 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 352 aa  739    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  95.45 
 
 		 352 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  56.89 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 3145 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  35.03 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  37.92 
 
 		 397 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  31.5 
 
 		 848 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 		 679 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  26.15 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  23.4 
 
 		 616 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 		 388 aa  46.6  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  23.4 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  21.91 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1949  glycogen synthase  25 
 
 		 477 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.327128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5037  glycogen synthase  24.7 
 
 		 469 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>