49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3367 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
339 aa  710    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  57.48 
 
 
352 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  56.89 
 
 
352 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  39.1 
 
 
400 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 
3145 aa  182  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  33.33 
 
 
397 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  33.94 
 
 
848 aa  146  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 
359 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
359 aa  83.6  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
374 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25.68 
 
 
616 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
679 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
624 aa  63.5  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 
396 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
384 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  24.24 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 
344 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  27.67 
 
 
344 aa  52.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
995 aa  48.1  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  23.57 
 
 
345 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
1233 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
344 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
386 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11776  glycosyl transferase  23.04 
 
 
381 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.99467e-19  hitchhiker  0.0000000000422341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  30.05 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  25.45 
 
 
1219 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1712  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.170704  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  27.43 
 
 
420 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1586  glycosyl transferase, group 1  37.7 
 
 
342 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.514056  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  27.84 
 
 
439 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.86 
 
 
348 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.52 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1658  glycosyl transferase, group 1  40.82 
 
 
372 aa  43.9  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00025615  hitchhiker  0.00378247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
411 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
420 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5894  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 
382 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262799  normal  0.416223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
379 aa  42.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
382 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
379 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1961  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
350 aa  42.7  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  22.66 
 
 
345 aa  42.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
404 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0821  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  31.82 
 
 
401 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0720659  normal  0.0739715 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1145  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 
373 aa  42.7  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>