23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3749 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3834  glycosyl transferase group 1  95.45 
 
 		 352 aa  709    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3749  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 352 aa  740    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3367  glycosyl transferase group 1  57.48 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3864  glycosyltransferase protein  35.71 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.431129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 3145 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2923  hypothetical protein  37.58 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0050  hypothetical protein  31.23 
 
 		 848 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.159927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 679 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 624 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 389 aa  49.3  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  23.03 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4775  glycogen synthase  25.59 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.385965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5664  putative glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 616 aa  43.9  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  23.5 
 
 		 386 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 725 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 411 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>