More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0541 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  100 
 
 		 444 aa  884    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.33 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 433 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  44.08 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 432 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  43.24 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  39.29 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 434 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 448 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  40 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  39.05 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 440 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  32.61 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 446 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.94 
 
 		 448 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 443 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  24.87 
 
 		 453 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 435 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 460 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  24.94 
 
 		 447 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 430 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 430 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0068  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 447 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.274354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28 
 
 		 436 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.28 
 
 		 437 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  28 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  28 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  28 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.15 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.3 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  24.55 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  22.98 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0299  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  24.51 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 426 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  23.15 
 
 		 458 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 410 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 427 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  22.51 
 
 		 459 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  24.15 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 479 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  28.04 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 439 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 432 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 430 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 423 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>