More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0012 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0012  guanylate kinase  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.897517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1016  guanylate kinase  50.82 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1456  guanylate kinase  48.39 
 
 		 190 aa  187  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000938556  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2168  guanylate kinase  47.06 
 
 		 188 aa  185  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.822318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4197  guanylate kinase  47.09 
 
 		 189 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00373006  normal  0.574711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1773  guanylate kinase  49.18 
 
 		 197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.159684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0599  guanylate kinase  46.81 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.68326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0404  guanylate kinase  48.09 
 
 		 194 aa  175  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0209165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5548  guanylate kinase  45.16 
 
 		 199 aa  171  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0742  guanylate kinase  44.5 
 
 		 190 aa  167  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0512  guanylate kinase  44.09 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02200  guanylate kinase  43.48 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  41.4 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0375  guanylate kinase  45.74 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0296296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0306  guanylate kinase  45.16 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0726977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0408  guanylate kinase  44.68 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.308329  normal  0.957996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3827  guanylate kinase  45.41 
 
 		 189 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.536013  normal  0.161762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  43.17 
 
 		 183 aa  158  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0765  Guanylate kinase  45.9 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0958444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.71 
 
 		 200 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  44.75 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  44.2 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  46.67 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  43.68 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  47.78 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  47.78 
 
 		 212 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2052  guanylate kinase  46.45 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  46.11 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  46.11 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  45.2 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  46.11 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0373  guanylate kinase  42.55 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.282119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  47.49 
 
 		 208 aa  151  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  46.63 
 
 		 204 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  47.78 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  47.78 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  44.75 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  47.37 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0915  guanylate kinase  45.11 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  47.22 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  47.22 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0407  guanylate kinase  42.78 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.360667  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  40.33 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1780  guanylate kinase  42.78 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0438453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  45.9 
 
 		 259 aa  149  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  43.33 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.29 
 
 		 217 aa  148  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12550  guanylate kinase  46.15 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  43.09 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  42.22 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  46.03 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  44.13 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  45.03 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  42.22 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  44.89 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  42.93 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  41.99 
 
 		 209 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  39.89 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  45.03 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  41.67 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2259  guanylate kinase  43.65 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294995  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  45.71 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  40.44 
 
 		 194 aa  145  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  43.89 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  46.78 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.52 
 
 		 207 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  42.71 
 
 		 203 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  44.92 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0299  guanylate kinase  44.51 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  37.16 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  45.25 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  46.37 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  41.44 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  42.54 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  39.44 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  43.09 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  42.86 
 
 		 223 aa  143  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  43.09 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  43.78 
 
 		 223 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  40.32 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  44.75 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  44.69 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0439  guanylate kinase  40.91 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.483895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  41.67 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  46.45 
 
 		 186 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  46.96 
 
 		 206 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  44.13 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  42.05 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1319  guanylate kinase  45.95 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.773987  normal  0.110661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  46.11 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  46.07 
 
 		 212 aa  141  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  43.96 
 
 		 215 aa  141  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  40.54 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  42.31 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  36.61 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  44.38 
 
 		 234 aa  140  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3195  guanylate kinase  42.7 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0922592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  47.4 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  44.05 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0251  guanylate kinase  42.77 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000337673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>