More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3894 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  59.69 
 
 
207 aa  254  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  59.47 
 
 
204 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  57.07 
 
 
216 aa  235  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  57.07 
 
 
216 aa  235  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  55.67 
 
 
205 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  53.65 
 
 
198 aa  226  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  55.79 
 
 
204 aa  226  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  55.38 
 
 
194 aa  225  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  48.99 
 
 
201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  55.26 
 
 
205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  52.88 
 
 
203 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  57.3 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  58.03 
 
 
205 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  57.51 
 
 
205 aa  218  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  57.51 
 
 
205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  57.51 
 
 
205 aa  218  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  55.32 
 
 
209 aa  217  7.999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  56.48 
 
 
205 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  56.48 
 
 
205 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  56.48 
 
 
205 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  56.48 
 
 
205 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  54.08 
 
 
197 aa  216  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  56.48 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  56.48 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  56.48 
 
 
214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  54.74 
 
 
209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  49.74 
 
 
207 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  51.58 
 
 
206 aa  209  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  49.47 
 
 
203 aa  207  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  50.26 
 
 
207 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  50.26 
 
 
207 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  50.27 
 
 
202 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  51.06 
 
 
199 aa  204  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  51.08 
 
 
195 aa  203  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  51.06 
 
 
204 aa  202  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  48.4 
 
 
204 aa  201  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  52.22 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  47.37 
 
 
203 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  52.41 
 
 
190 aa  198  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  46.88 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  48.68 
 
 
198 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  48.95 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  47.45 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  46.94 
 
 
220 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  46.43 
 
 
219 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  47.96 
 
 
220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  48.13 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  49.47 
 
 
207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  47.37 
 
 
202 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  52.51 
 
 
186 aa  194  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  51.1 
 
 
199 aa  194  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  48.95 
 
 
207 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  46.2 
 
 
202 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  48.63 
 
 
194 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  50.28 
 
 
188 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  48.42 
 
 
207 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  50.28 
 
 
184 aa  191  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  48.42 
 
 
207 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  48.42 
 
 
207 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  48.42 
 
 
207 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  48.42 
 
 
207 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  50 
 
 
198 aa  191  7e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  48.42 
 
 
207 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  47.89 
 
 
207 aa  190  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  47.92 
 
 
211 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  50.82 
 
 
207 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  47.92 
 
 
211 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  45.99 
 
 
198 aa  189  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  45 
 
 
212 aa  188  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  44.74 
 
 
210 aa  188  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  46.63 
 
 
213 aa  187  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  45 
 
 
215 aa  187  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  51.11 
 
 
191 aa  187  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  46.35 
 
 
220 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  48.15 
 
 
259 aa  186  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  48.91 
 
 
203 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  50.28 
 
 
195 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  47.78 
 
 
202 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  48.37 
 
 
233 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  46.35 
 
 
219 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  47.89 
 
 
202 aa  185  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  44.67 
 
 
206 aa  185  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  50.81 
 
 
216 aa  185  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  48.02 
 
 
184 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  50 
 
 
199 aa  185  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  45.74 
 
 
204 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  48.37 
 
 
203 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  46.15 
 
 
218 aa  184  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  47.73 
 
 
192 aa  184  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  43.15 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.11 
 
 
207 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.9 
 
 
224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>