More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1315 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  53.3 
 
 		 201 aa  225  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  52.88 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  47.5 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  47.92 
 
 		 206 aa  201  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  50 
 
 		 204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  49.47 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  50.25 
 
 		 194 aa  194  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  48.95 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  46.81 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  46.88 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  49.48 
 
 		 205 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  46.88 
 
 		 209 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  50.26 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  50.26 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  46.35 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  45.74 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  45.74 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  48.04 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  48.04 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  47.89 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  48.68 
 
 		 204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2523  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  44.72 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1713  guanylate kinase  44.27 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.463283  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  44.72 
 
 		 211 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3722  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3919  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  44.21 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4009  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3885  guanylate kinase  50 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000575833 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3914  guanylate kinase  50 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3612  guanylate kinase  50 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3630  guanylate kinase  50 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3970  guanylate kinase  49.47 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0125676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1273  guanylate kinase  49.47 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  46.15 
 
 		 225 aa  177  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1231  guanylate kinase  44.39 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.726797  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  42.56 
 
 		 212 aa  177  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  46.37 
 
 		 184 aa  177  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3694  guanylate kinase  48.95 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  42.49 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.15 
 
 		 207 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  44.68 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  45.31 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  43.01 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  46.84 
 
 		 198 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  43.78 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  45.79 
 
 		 202 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  46.37 
 
 		 194 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0208  guanylate kinase  44.62 
 
 		 297 aa  174  9e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  43.23 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  45.25 
 
 		 186 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.15 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  44.04 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  43.09 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  42.08 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  43.78 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  43.81 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  44.15 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  42.33 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  47.03 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  47.78 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  44.15 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl195  guanylate kinase  44.39 
 
 		 297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0722226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  43.75 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  43.62 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  41.18 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5204  guanylate kinase  43.81 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.952406  normal  0.288026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  43.78 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  43.62 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  43.62 
 
 		 210 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  46.49 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  43.62 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  47.54 
 
 		 192 aa  171  7.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  43.09 
 
 		 210 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5296  guanylate kinase  43.3 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0446222  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  44.72 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  43.48 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  41.5 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  43.09 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  43.23 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  42.57 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  43.62 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  42.93 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  41.36 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  41.97 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  44.44 
 
 		 207 aa  167  7e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>