More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1473 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  100 
 
 
191 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  55.88 
 
 
199 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  52.57 
 
 
233 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  52.49 
 
 
188 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  51.93 
 
 
184 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  52.25 
 
 
185 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  51.11 
 
 
200 aa  187  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.88 
 
 
198 aa  187  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  50.28 
 
 
186 aa  186  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  50.55 
 
 
194 aa  185  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  50.83 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  52.78 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5345  guanylate kinase  53.98 
 
 
204 aa  180  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1715  guanylate kinase  52.25 
 
 
218 aa  178  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244891  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  50 
 
 
192 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  55.43 
 
 
205 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  52.87 
 
 
209 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  48.35 
 
 
206 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  49.15 
 
 
189 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  53.04 
 
 
204 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  48.62 
 
 
185 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  46.96 
 
 
207 aa  174  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  47.51 
 
 
207 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3208  guanylate kinase  53.37 
 
 
186 aa  174  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.703275  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  48.24 
 
 
204 aa  174  8e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  46.96 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  48.07 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  48.07 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  48.07 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  46.96 
 
 
224 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  50.28 
 
 
195 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  48.33 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  46.96 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4162  guanylate kinase  51.09 
 
 
194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13383  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  47.51 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  47.37 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  46.11 
 
 
203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  52.57 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2158  guanylate kinase  50.28 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.51 
 
 
207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  52 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  48.07 
 
 
199 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2370  guanylate kinase  47.37 
 
 
198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0470056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2417  guanylate kinase  47.37 
 
 
198 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.391978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  48.66 
 
 
202 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1191  guanylate kinase  53.76 
 
 
183 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997306  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  46.41 
 
 
224 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  46.67 
 
 
207 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0483  guanylate kinase  43.02 
 
 
181 aa  169  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  43.78 
 
 
212 aa  169  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2813  Guanylate kinase  48.59 
 
 
234 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.672067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1996  guanylate kinase  50.28 
 
 
197 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000144214 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  46.11 
 
 
207 aa  168  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  44.44 
 
 
192 aa  168  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  45 
 
 
203 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  44.44 
 
 
207 aa  167  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3007  guanylate kinase  48.04 
 
 
223 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000380844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  48.6 
 
 
203 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  44.2 
 
 
210 aa  167  8e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  50.56 
 
 
216 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  48.59 
 
 
196 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1799  guanylate kinase  45.98 
 
 
186 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2345  guanylate kinase  49.71 
 
 
193 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  41.01 
 
 
184 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  44.19 
 
 
201 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  47.83 
 
 
207 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1360  guanylate kinase  47.78 
 
 
199 aa  166  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.288733  normal  0.0500423 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  41.01 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11418  guanylate kinase  46.11 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747341  normal  0.348875 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  44.2 
 
 
217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  45.81 
 
 
214 aa  165  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  47.73 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  48.04 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45.3 
 
 
207 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05221  guanylate kinase  45.98 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.645705  normal  0.16422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  46.67 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  46.67 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  47.49 
 
 
209 aa  165  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5238  guanylate kinase  49.72 
 
 
199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3157  guanylate kinase  43.85 
 
 
209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250425  hitchhiker  0.0000168585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1293  guanylate kinase  50.85 
 
 
208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.316602  normal  0.120188 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  45.83 
 
 
204 aa  164  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  45.86 
 
 
209 aa  164  8e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  49.13 
 
 
190 aa  164  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05311  guanylate kinase  42.7 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  47.98 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  47.98 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.2 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  46.2 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  46.2 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  46.2 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  46.2 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  46.2 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  45.65 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  45.65 
 
 
207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>