More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2238 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  100 
 
 		 203 aa  416  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  84.16 
 
 		 203 aa  360  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  73.27 
 
 		 202 aa  319  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  72.77 
 
 		 202 aa  317  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  71.78 
 
 		 202 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  60.4 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  58.13 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  58.42 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  55.79 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  49.47 
 
 		 200 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  53.16 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  46.97 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  47.4 
 
 		 204 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  48.65 
 
 		 194 aa  197  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  50.26 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  52.11 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  51.09 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  53.51 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  52.11 
 
 		 207 aa  194  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  53.51 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  51.11 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  51.09 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  51.06 
 
 		 205 aa  188  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  52.72 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  43.46 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  45.69 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  50.54 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  48.44 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  48.96 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  47.98 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  49.21 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  51.08 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  51.63 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  45.5 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  44 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  44 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  45.26 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  44.5 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  47.34 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  51.85 
 
 		 206 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4492  guanylate kinase  53.16 
 
 		 207 aa  185  5e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  45.77 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  48.68 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  50.53 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  50.53 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  50.53 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  50.27 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4209  guanylate kinase  52.63 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  45 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  47.31 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  44.68 
 
 		 195 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  47.4 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  47.8 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  44.06 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  49.46 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  46.99 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  48.7 
 
 		 212 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  43.56 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  44.06 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  42.08 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  44.5 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  45 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  44.06 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  46.53 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  48.47 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  48.15 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  46.88 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  49.73 
 
 		 207 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  49.21 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  46.84 
 
 		 202 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  45.41 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  47.12 
 
 		 210 aa  177  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  45.55 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  43.56 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  46.08 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  43.56 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  43.78 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  43.56 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  43.56 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  46.28 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  45.26 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  47.67 
 
 		 220 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  40.5 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  47.12 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  47.83 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5344  guanylate kinase  48.68 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  46.63 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>