More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1406 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  58.5 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  59.5 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  58 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  54.55 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  56.22 
 
 		 215 aa  209  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  54.35 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  53.93 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  53.23 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  53.8 
 
 		 202 aa  202  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  53.26 
 
 		 203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  51.09 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  55.14 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  49.5 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  43.28 
 
 		 204 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  49 
 
 		 219 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  49.17 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  44.9 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  47.76 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  51.37 
 
 		 259 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  47.76 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  46.19 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  47.92 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.62 
 
 		 198 aa  177  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  48.44 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  45.92 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  46.77 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  44.5 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  48.39 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  48.99 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  50.79 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  47.98 
 
 		 230 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  48.99 
 
 		 223 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  48.48 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.97 
 
 		 207 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  45.5 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  46.77 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  47.21 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  47.89 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  48.9 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  50.56 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  44.67 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0758  guanylate kinase  45.5 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183217  hitchhiker  0.0000103593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  43.98 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0502  guanylate kinase  47.37 
 
 		 221 aa  167  8e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  48.99 
 
 		 218 aa  167  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  52.51 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  47.85 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  50.54 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  47.25 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  41.36 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  45.81 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  46.35 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  48.09 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  51.96 
 
 		 225 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  48.62 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1473  guanylate kinase  47.73 
 
 		 191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  51.96 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  45.96 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  46.45 
 
 		 207 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  46.99 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  46.99 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  43.62 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1089  guanylate kinase  45.5 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.350405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  46.99 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  43.62 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  48.88 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  50 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  46.15 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  45.3 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  43.96 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  46.11 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  46.45 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  46.07 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  47.98 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  47.78 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  41.54 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  48.37 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  45.86 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  42.7 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  46.99 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  45.83 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  46.74 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  42.71 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45.6 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.9 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  46.99 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  45.77 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  45.77 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  44.5 
 
 		 207 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  42.79 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>