More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0294 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  100 
 
 
212 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  63.24 
 
 
207 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  60.78 
 
 
209 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  59.9 
 
 
215 aa  249  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  59.9 
 
 
206 aa  249  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  54.55 
 
 
202 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  55.1 
 
 
259 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  49.21 
 
 
203 aa  186  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  48.02 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  50.28 
 
 
199 aa  182  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  48.68 
 
 
210 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  46.27 
 
 
214 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  46.52 
 
 
203 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  41.41 
 
 
204 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  52.97 
 
 
225 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  53.89 
 
 
226 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  50.8 
 
 
202 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  48.99 
 
 
219 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  52.43 
 
 
225 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  41.15 
 
 
216 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  44.44 
 
 
200 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  48.85 
 
 
188 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  48.85 
 
 
184 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  41.15 
 
 
216 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  46.23 
 
 
211 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  53.51 
 
 
223 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  48.9 
 
 
202 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  40.31 
 
 
207 aa  174  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  50.55 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  45 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  43.89 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  46.7 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  47.06 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  47.06 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  50.56 
 
 
224 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  171  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  47.46 
 
 
185 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  46.77 
 
 
189 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  45.83 
 
 
185 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1062  guanylate kinase  47.64 
 
 
196 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  46.89 
 
 
186 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  41.5 
 
 
204 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  50 
 
 
207 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  47.5 
 
 
218 aa  168  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  45.7 
 
 
233 aa  167  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  48.88 
 
 
224 aa  167  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  43.92 
 
 
210 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18030  guanylate kinase  48.39 
 
 
199 aa  167  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0118922  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  47.16 
 
 
190 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  45.54 
 
 
210 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  46.7 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.89 
 
 
202 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  48.42 
 
 
202 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  45.54 
 
 
210 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  46.7 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  47.28 
 
 
219 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  45.54 
 
 
210 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  46.7 
 
 
203 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  46.39 
 
 
220 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  49.44 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  47.85 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  45.54 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  46.88 
 
 
204 aa  165  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0545  guanylate kinase  44.39 
 
 
203 aa  165  5e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  43.94 
 
 
207 aa  165  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  48.88 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  48.3 
 
 
228 aa  164  8e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3426  Guanylate kinase  45 
 
 
194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  48.85 
 
 
199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  43.27 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  46.74 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  45.13 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  45.36 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  43.54 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  45.45 
 
 
218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  47.37 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  43.54 
 
 
223 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05231  guanylate kinase  42.17 
 
 
184 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1256  guanylate kinase  42.5 
 
 
203 aa  162  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  41.24 
 
 
217 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  44.51 
 
 
195 aa  162  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  43.98 
 
 
209 aa  162  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  44.09 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  43.72 
 
 
207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  46.03 
 
 
207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  45.51 
 
 
192 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04921  guanylate kinase  42.17 
 
 
184 aa  161  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.032848  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3097  guanylate kinase  48.09 
 
 
195 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1563  guanylate kinase  46.23 
 
 
211 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2919  guanylate kinase  46.23 
 
 
211 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3193  guanylate kinase  47.14 
 
 
219 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4867  guanylate kinase  48.6 
 
 
207 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807857  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>