More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2286 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  100 
 
 
202 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  64.85 
 
 
202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  59.41 
 
 
203 aa  252  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  59.41 
 
 
202 aa  251  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  58.42 
 
 
202 aa  248  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  58.42 
 
 
203 aa  246  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  60.89 
 
 
202 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  53.47 
 
 
210 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  55.14 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  48.77 
 
 
207 aa  190  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  48.17 
 
 
207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  46.53 
 
 
210 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  46.53 
 
 
210 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  46.53 
 
 
210 aa  187  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  46.77 
 
 
224 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  46.04 
 
 
210 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  47.54 
 
 
194 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  47.29 
 
 
207 aa  185  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0266  guanylate kinase  48.69 
 
 
207 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  47.89 
 
 
200 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  45.05 
 
 
207 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3623  guanylate kinase  45.6 
 
 
207 aa  182  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  46.39 
 
 
210 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  46.53 
 
 
207 aa  181  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  48.13 
 
 
210 aa  181  7e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1266  guanylate kinase  49.2 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.979121  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  45.05 
 
 
207 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.05 
 
 
224 aa  180  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2444  guanylate kinase  49.73 
 
 
203 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.337517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  49.22 
 
 
259 aa  180  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  48.65 
 
 
209 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  44.55 
 
 
207 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  178  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  44.28 
 
 
200 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  49.72 
 
 
207 aa  177  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  50.8 
 
 
212 aa  177  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  48.09 
 
 
206 aa  176  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  46.28 
 
 
214 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.07 
 
 
202 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  43.5 
 
 
207 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  44.68 
 
 
216 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  44.68 
 
 
216 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  43.5 
 
 
207 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  46.94 
 
 
212 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1529  guanylate kinase  46.35 
 
 
217 aa  174  8e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.2579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  47.06 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  41.67 
 
 
204 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  47.09 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  46.28 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  42.63 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  44.81 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2440  guanylate kinase  47.37 
 
 
218 aa  171  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682251 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  45.21 
 
 
212 aa  171  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  47.54 
 
 
220 aa  171  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  45.73 
 
 
220 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  46.15 
 
 
219 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  44.38 
 
 
183 aa  170  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  46.7 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  46.7 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  39.5 
 
 
201 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  46.7 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  46.7 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  44.9 
 
 
209 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3049  guanylate kinase  46.7 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.520623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  46.7 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  46.7 
 
 
227 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  48.63 
 
 
212 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  42.13 
 
 
205 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  48.63 
 
 
212 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  168  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2280  guanylate kinase  43.72 
 
 
229 aa  168  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  44.33 
 
 
220 aa  168  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0347  guanylate kinase  43.48 
 
 
215 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  44.74 
 
 
207 aa  168  6e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0871  guanylate kinase  43.88 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  47.8 
 
 
215 aa  168  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0859  guanylate kinase  43.88 
 
 
227 aa  168  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675802  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1845  guanylate kinase  48.69 
 
 
230 aa  167  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  45.73 
 
 
220 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  43.96 
 
 
216 aa  167  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0210  guanylate kinase  42.86 
 
 
207 aa  167  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  45.32 
 
 
219 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  46.88 
 
 
223 aa  167  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  46.88 
 
 
223 aa  167  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  45.6 
 
 
206 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  44.56 
 
 
204 aa  166  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  45.64 
 
 
220 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  43.37 
 
 
227 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_004310  BR0464  guanylate kinase  48.11 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.328382  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0469  guanylate kinase  48.11 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1586  guanylate kinase  46.15 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0562043  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  45.13 
 
 
220 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  48.09 
 
 
219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.21 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.21 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>