More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2719 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2719  guanylate kinase  100 
 
 
206 aa  420  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00356396  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  77.67 
 
 
209 aa  332  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  74.63 
 
 
207 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0294  guanylate kinase  59.9 
 
 
212 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  59.5 
 
 
202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2902  guanylate kinase  58.29 
 
 
215 aa  228  5e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  47.25 
 
 
203 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  47.25 
 
 
202 aa  184  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  47.25 
 
 
202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  47.28 
 
 
202 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  47.8 
 
 
203 aa  181  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  52.97 
 
 
202 aa  180  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  49.45 
 
 
210 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  51.63 
 
 
204 aa  178  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  48.09 
 
 
202 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17617  predicted protein  45.89 
 
 
227 aa  175  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.910339  hitchhiker  0.000867282 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5842  guanylate kinase  51.91 
 
 
259 aa  175  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3354  guanylate kinase  50.28 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  41.53 
 
 
202 aa  171  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2523  guanylate kinase  45.05 
 
 
214 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1730  guanylate kinase  51.7 
 
 
199 aa  169  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  49.18 
 
 
209 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1535  guanylate kinase  45.23 
 
 
220 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0748909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1953  guanylate kinase  47.78 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217119  normal  0.0786696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2000  guanylate kinase  47.55 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0607745  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2692  guanylate kinase  51.69 
 
 
225 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2277  guanylate kinase  47.55 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.140709  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2606  guanylate kinase  51.69 
 
 
226 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2787  guanylate kinase  51.69 
 
 
225 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1062  guanylate kinase  45.63 
 
 
220 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3720  guanylate kinase  49.72 
 
 
220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0647286  normal  0.109171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3155  guanylate kinase  48.6 
 
 
220 aa  165  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  38.71 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  43.72 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  48.86 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1078  guanylate kinase  47.43 
 
 
212 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  41 
 
 
207 aa  161  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4981  guanylate kinase  44.07 
 
 
198 aa  161  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.023832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2573  guanylate kinase  52.25 
 
 
223 aa  161  7e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0392077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1205  guanylate kinase  45.15 
 
 
220 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197853  hitchhiker  0.00108752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  41.44 
 
 
194 aa  160  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0759  guanylate kinase  44.61 
 
 
219 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  46.59 
 
 
210 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0632  guanylate kinase  48 
 
 
185 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10188  hypothetical protein similar to guanylate kinase (Broad)  45.45 
 
 
228 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.585201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  39.56 
 
 
204 aa  159  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3877  guanylate kinase  42.21 
 
 
210 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1475  guanylate kinase  45.56 
 
 
199 aa  158  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000468376  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  42.22 
 
 
200 aa  158  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1763  guanylate kinase  46.43 
 
 
218 aa  158  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3497  guanylate kinase  42.21 
 
 
207 aa  158  6e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1104  guanylate kinase  44.28 
 
 
211 aa  157  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.631702  normal  0.011032 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0988  guanylate kinase  45.37 
 
 
234 aa  158  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0107524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2537  guanylate kinase  42.29 
 
 
183 aa  157  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04671  guanylate kinase  43.02 
 
 
185 aa  157  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0895533  normal  0.75989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  46.7 
 
 
202 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  42.71 
 
 
210 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  42.71 
 
 
210 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  42.71 
 
 
210 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  37.31 
 
 
204 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3136  guanylate kinase  46.24 
 
 
231 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.328978 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  46.2 
 
 
206 aa  156  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  41.71 
 
 
224 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  46.2 
 
 
210 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  42.16 
 
 
207 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  41.21 
 
 
195 aa  156  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  45.74 
 
 
219 aa  155  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  42.21 
 
 
210 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1796  guanylate kinase  42.93 
 
 
206 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0793  guanylate kinase  45.71 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.637166 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  42.21 
 
 
207 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06681  guanylate kinase  46.02 
 
 
192 aa  154  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  42.16 
 
 
207 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  42.42 
 
 
207 aa  154  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0808  guanylate kinase  44.44 
 
 
192 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.116088  normal  0.89906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  41.71 
 
 
207 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  43.33 
 
 
204 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0048  guanylate kinase  44.89 
 
 
202 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  40.7 
 
 
207 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  41.21 
 
 
224 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  41.67 
 
 
207 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  45.9 
 
 
221 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2578  guanylate kinase  46.07 
 
 
202 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0638633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  45.11 
 
 
233 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  41.21 
 
 
207 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00153  guanylate kinase  43.41 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  37.5 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  37.5 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4124  Guanylate kinase  44.86 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>