More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3162 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3162  guanylate kinase  100 
 
 
202 aa  416  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0281521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  75.74 
 
 
202 aa  322  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  75.25 
 
 
202 aa  321  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  71.78 
 
 
203 aa  318  3e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  71.78 
 
 
203 aa  310  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  59.9 
 
 
202 aa  258  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2286  guanylate kinase  60.89 
 
 
202 aa  254  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  58.91 
 
 
210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2472  guanylate kinase  51.04 
 
 
220 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  48.94 
 
 
206 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  48.33 
 
 
202 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  48.94 
 
 
206 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.46 
 
 
200 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1406  Guanylate kinase  50.79 
 
 
202 aa  190  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.77411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  48.94 
 
 
206 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  46.81 
 
 
200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1910  guanylate kinase  49.46 
 
 
210 aa  188  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000116154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3479  guanylate kinase  50 
 
 
220 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  45.83 
 
 
204 aa  188  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2974  guanylate kinase  50.52 
 
 
219 aa  188  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.84 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  47.34 
 
 
206 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  49.47 
 
 
204 aa  186  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  46.81 
 
 
202 aa  186  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  47.89 
 
 
207 aa  185  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  48.65 
 
 
194 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3936  guanylate kinase  48.19 
 
 
212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  48.4 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  42.29 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  44.79 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0811  guanylate kinase  46.81 
 
 
206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990051 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  45.21 
 
 
206 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1138  Guanylate kinase  48.63 
 
 
209 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  48.91 
 
 
221 aa  181  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  47.57 
 
 
209 aa  181  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02830  guanylate kinase  49.47 
 
 
205 aa  181  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  45.03 
 
 
204 aa  180  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0729  guanylate kinase  47.34 
 
 
209 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2084  guanylate kinase  46.77 
 
 
207 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.338387  decreased coverage  0.00871463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  47.37 
 
 
207 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2715  guanylate kinase  44 
 
 
206 aa  179  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  0.772738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3810  guanylate kinase  46 
 
 
207 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.18291  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1956  guanylate kinase  48.37 
 
 
221 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.414906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0361  guanylate kinase  45 
 
 
207 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0473  guanylate kinase  45.92 
 
 
209 aa  177  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  45.21 
 
 
217 aa  177  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0577  guanylate kinase  45.05 
 
 
204 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.213259  normal  0.177715 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  47.83 
 
 
221 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4581  guanylate kinase  46.46 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.877029  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  44.15 
 
 
206 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2003  guanylate kinase  43.32 
 
 
208 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3778  guanylate kinase  50.27 
 
 
233 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  41.75 
 
 
207 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0330  guanylate kinase  45.5 
 
 
224 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0351596  normal  0.331396 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3630  guanylate kinase  45.5 
 
 
224 aa  175  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.09026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3613  guanylate kinase  45 
 
 
207 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0856  guanylate kinase  45.65 
 
 
216 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1723  guanylate kinase  43.32 
 
 
208 aa  175  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0363  guanylate kinase  47.54 
 
 
210 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000053777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70440  guanylate kinase  46.74 
 
 
203 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  46.81 
 
 
210 aa  174  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0360  guanylate kinase  47.54 
 
 
210 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0353  guanylate kinase  47.54 
 
 
210 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0355  guanylate kinase  47.54 
 
 
210 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.398163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6112  guanylate kinase  46.74 
 
 
203 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0336  guanylate kinase  46.99 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.57704 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4218  guanylate kinase  45.21 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4384  guanylate kinase  45.21 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3433  guanylate kinase  44.44 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0365  guanylate kinase  45.36 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3823  guanylate kinase  46.35 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.162212 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  46.32 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  46.52 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0075  guanylate kinase  44.88 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  47.57 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  49.74 
 
 
201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0052  guanylate kinase  44.97 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00408303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  47.57 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2401  guanylate kinase  45.11 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0815  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.605718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1964  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.736317  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2648  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2096  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3015  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5549  guanylate kinase  44.92 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.405224 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2949  guanylate kinase  45.65 
 
 
227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>