More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1677 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1677  guanylate kinase  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0099  guanylate kinase  61.7 
 
 
204 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.261524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0985  guanylate kinase  55.79 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00175631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1145  guanylate kinase  55.5 
 
 
207 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.49439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0962  guanylate kinase  50.52 
 
 
202 aa  211  7e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0132271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1700  guanylate kinase  50.81 
 
 
200 aa  208  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1761  guanylate kinase  47.64 
 
 
207 aa  201  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0100  guanylate kinase  48.94 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0912271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09810  Guanylate kinase  51.34 
 
 
194 aa  198  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1035  guanylate kinase  48.42 
 
 
199 aa  197  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3894  guanylate kinase  46.88 
 
 
200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000112061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1237  guanylate kinase  47.57 
 
 
195 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.74814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1329  guanylate kinase  46.28 
 
 
204 aa  188  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000708025  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3630  guanylate kinase  47.28 
 
 
209 aa  184  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.601224  normal  0.100424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1597  guanylate kinase  46.2 
 
 
197 aa  182  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00198885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3695  guanylate kinase  44.9 
 
 
225 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1791  guanylate kinase  42.33 
 
 
201 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1058  guanylate kinase  44.55 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000145749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0563  guanylate kinase  44.61 
 
 
212 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0717  guanylate kinase  44.61 
 
 
212 aa  180  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000116826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0785  guanylate kinase  50 
 
 
201 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000101008  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2238  guanylate kinase  42.08 
 
 
203 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1948  guanylate kinase  45.74 
 
 
205 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1285  guanylate kinase  46.77 
 
 
210 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4145  guanylate kinase  46.39 
 
 
207 aa  180  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3948  guanylate kinase  45.88 
 
 
207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.498976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2093  guanylate kinase  48.39 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.353708  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03505  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0057  Guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0776  guanylate kinase  44.55 
 
 
207 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4151  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3983  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4099  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0063  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3859  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03457  hypothetical protein  44.1 
 
 
207 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1992  guanylate kinase  43.78 
 
 
209 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1987  guanylate kinase  43.78 
 
 
209 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2001  guanylate kinase  43.88 
 
 
216 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1719  guanylate kinase  43.92 
 
 
216 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2975  guanylate kinase  42.57 
 
 
204 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2003  guanylate kinase  44.28 
 
 
216 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1398  guanylate kinase  44.06 
 
 
209 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1315  guanylate kinase  43.01 
 
 
203 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.559001  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1457  guanylate kinase  43.2 
 
 
212 aa  175  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2327  guanylate kinase  42.7 
 
 
203 aa  174  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000761567  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0947  guanylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  174  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000973722  hitchhiker  0.000000351977 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3187  Guanylate kinase  44.78 
 
 
210 aa  174  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0862  guanylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1443  guanylate kinase  47.62 
 
 
210 aa  174  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.86751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4020  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3948  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531185 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5020  guanylate kinase  43.59 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3957  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00630  guanylate kinase  43.52 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4066  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0840  guanylate kinase  45.5 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4127  guanylate kinase  44.1 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.514606  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2318  guanylate kinase  41.71 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000195285  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0045  guanylate kinase  45.08 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0843  guanylate kinase  44.97 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0041  guanylate kinase  45.08 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4176  guanylate kinase  45.08 
 
 
207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0297777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2028  guanylate kinase  44.74 
 
 
220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413126  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0091  guanylate kinase  43.59 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0035  guanylate kinase  44.95 
 
 
209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3845  guanylate kinase  42.86 
 
 
202 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3213  guanylate kinase  44.15 
 
 
202 aa  171  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000935163  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1683  guanylate kinase  42.49 
 
 
219 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001862  guanylate kinase  43.01 
 
 
207 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3233  guanylate kinase  44.44 
 
 
215 aa  171  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0756  guanylate kinase  44.97 
 
 
204 aa  171  9e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1268  guanylate kinase  43.22 
 
 
207 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0195  guanylate kinase  46.96 
 
 
188 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1050  guanylate kinase  43.62 
 
 
202 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000462152 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1293  guanylate kinase  43.22 
 
 
207 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3147  guanylate kinase  41.8 
 
 
206 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0190  guanylate kinase  46.96 
 
 
184 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1176  guanylate kinase  42.63 
 
 
206 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000749098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2155  guanylate kinase  42.86 
 
 
221 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000431933  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4107  guanylate kinase  45.21 
 
 
227 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0130992  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0976  guanylate kinase  43.46 
 
 
211 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.194665  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1220  guanylate kinase  44.79 
 
 
218 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.289802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2401  guanylate kinase  41.79 
 
 
202 aa  170  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0298091  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0313  guanylate kinase  44.68 
 
 
209 aa  169  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0875391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2305  guanylate kinase  43.01 
 
 
219 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00214709  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1335  guanylate kinase  41.8 
 
 
206 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2276  guanylate kinase  42.86 
 
 
221 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0318334  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4329  guanylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.970942  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07800  guanylate kinase  47.28 
 
 
189 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.364153  normal  0.897368 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2834  guanylate kinase  44.69 
 
 
186 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.522471  normal  0.276726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0177  guanylate kinase  41.36 
 
 
206 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000695034 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2411  guanylate kinase  43.89 
 
 
198 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4388  guanylate kinase  43.58 
 
 
205 aa  168  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11044 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0874  guanylate kinase  48.13 
 
 
205 aa  168  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000405091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2138  guanylate kinase  45.21 
 
 
205 aa  168  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.585915  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3583  guanylate kinase  42.86 
 
 
206 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00415905  normal  0.118983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2667  guanylate kinase  46.11 
 
 
203 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1660  guanylate kinase  45.5 
 
 
190 aa  168  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000545308  hitchhiker  0.000108168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4019  guanylate kinase  40.96 
 
 
204 aa  168  7e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>